48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2122 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2122  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  241  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7704  hypothetical protein  92.68 
 
 		 123 aa  226  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3815  hypothetical protein  78.05 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0782579  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1543  hypothetical protein  77.59 
 
 		 131 aa  185  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0356843 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3150  hypothetical protein  74.36 
 
 		 131 aa  180  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7395  hypothetical protein  72.73 
 
 		 123 aa  180  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0794  hypothetical protein  75.86 
 
 		 134 aa  156  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.544524 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2663  hypothetical protein  62.02 
 
 		 135 aa  143  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.996553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2010  hypothetical protein  62.6 
 
 		 124 aa  141  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2521  hypothetical protein  62 
 
 		 203 aa  113  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0162  hypothetical protein  56.57 
 
 		 121 aa  110  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0080  hypothetical protein  53.33 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4163  putative lipoprotein  48.18 
 
 		 116 aa  88.6  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2081  hypothetical protein  48.65 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2617  putative lipoprotein  44.55 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0460  putative lipoprotein  46.36 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3668  hypothetical protein  42.86 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2728  putative lipoprotein  45.45 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3027  hypothetical protein  45.45 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0599  hypothetical protein  46.9 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2936  putative lipoprotein  43.64 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36010  lipoprotein  45.45 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3529  putative lipoprotein  44.55 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348818  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0683  putative lipoprotein  44.55 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1482  hypothetical protein  44.55 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2083  putative lipoprotein  42.48 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1274  putative transposon  45.45 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31230  hypothetical protein  45.95 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000641802  unclonable  1.55201e-22 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1501  putative lipoprotein  45.45 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0353  hypothetical protein  38.66 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239332  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0470  hypothetical protein  44.55 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1475  hypothetical protein  44.55 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3038  hypothetical protein  42.73 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2608  hypothetical protein  42.73 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2738  hypothetical protein  41.82 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31150  hypothetical protein  42.73 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000059754  unclonable  1.00757e-22 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0677  hypothetical protein  44.64 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1259  putative lipoprotein  42.99 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3536  hypothetical protein  42.73 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1875  putative lipoprotein  42.73 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1285  putative lipoprotein  42.73 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2326  putative lipoprotein  42.73 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1250  hypothetical protein  41.82 
 
 		 193 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2650  putative lipoprotein  43.27 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.134828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3735  hypothetical protein  43.68 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2609  lipoprotein  42.53 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.707585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1041  hypothetical protein  43.14 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1116  hypothetical protein  43.18 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000322507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>