48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0683 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0683  putative lipoprotein  100 
 
 		 160 aa  325  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2609  lipoprotein  73.72 
 
 		 197 aa  203  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.707585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31150  hypothetical protein  78.29 
 
 		 133 aa  201  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000059754  unclonable  1.00757e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1250  hypothetical protein  61.31 
 
 		 193 aa  191  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2326  putative lipoprotein  79.31 
 
 		 116 aa  186  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3735  hypothetical protein  87.93 
 
 		 116 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3027  hypothetical protein  77.68 
 
 		 115 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2728  putative lipoprotein  77.68 
 
 		 115 aa  182  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0460  putative lipoprotein  79.46 
 
 		 115 aa  182  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36010  lipoprotein  74.58 
 
 		 118 aa  180  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2617  putative lipoprotein  76.79 
 
 		 115 aa  177  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1482  hypothetical protein  75.89 
 
 		 115 aa  177  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3529  putative lipoprotein  75.22 
 
 		 116 aa  174  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348818  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1285  putative lipoprotein  74.14 
 
 		 116 aa  174  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1875  putative lipoprotein  74.56 
 
 		 116 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2650  putative lipoprotein  74.56 
 
 		 116 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.134828 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2936  putative lipoprotein  75 
 
 		 115 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1259  putative lipoprotein  71.43 
 
 		 109 aa  159  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4163  putative lipoprotein  67.24 
 
 		 116 aa  159  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1501  putative lipoprotein  54.78 
 
 		 116 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2083  putative lipoprotein  55.96 
 
 		 113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1274  putative transposon  50.43 
 
 		 116 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3668  hypothetical protein  51.3 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3038  hypothetical protein  48.7 
 
 		 116 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2608  hypothetical protein  48.7 
 
 		 116 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31230  hypothetical protein  48.76 
 
 		 175 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000641802  unclonable  1.55201e-22 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1041  hypothetical protein  58.16 
 
 		 118 aa  107  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2738  hypothetical protein  47.83 
 
 		 116 aa  107  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0470  hypothetical protein  50.91 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0677  hypothetical protein  46.96 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759632 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1475  hypothetical protein  49.09 
 
 		 116 aa  101  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3536  hypothetical protein  47.17 
 
 		 116 aa  98.2  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2081  hypothetical protein  48.65 
 
 		 113 aa  97.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0599  hypothetical protein  44.25 
 
 		 115 aa  91.7  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2122  hypothetical protein  44.55 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7395  hypothetical protein  40.18 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2521  hypothetical protein  48.28 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7704  hypothetical protein  42.73 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0162  hypothetical protein  39.82 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2663  hypothetical protein  41.88 
 
 		 135 aa  73.6  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.996553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3815  hypothetical protein  42.73 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0782579  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3150  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0080  hypothetical protein  38.05 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2010  hypothetical protein  40.38 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1543  hypothetical protein  40.18 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0356843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0794  hypothetical protein  41 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.544524 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0353  hypothetical protein  36.45 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239332  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1116  hypothetical protein  36.84 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000322507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>