49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4163 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4163  putative lipoprotein  100 
 
 		 116 aa  236  9e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0683  putative lipoprotein  67.24 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1274  putative transposon  66.09 
 
 		 116 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3529  putative lipoprotein  63.79 
 
 		 116 aa  154  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348818  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36010  lipoprotein  67.86 
 
 		 118 aa  154  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2608  hypothetical protein  63.48 
 
 		 116 aa  153  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3038  hypothetical protein  63.48 
 
 		 116 aa  153  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31150  hypothetical protein  63.79 
 
 		 133 aa  153  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000059754  unclonable  1.00757e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2738  hypothetical protein  63.48 
 
 		 116 aa  153  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1285  putative lipoprotein  64.66 
 
 		 116 aa  152  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2326  putative lipoprotein  66.38 
 
 		 116 aa  153  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0470  hypothetical protein  65.79 
 
 		 116 aa  151  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0460  putative lipoprotein  65.18 
 
 		 115 aa  150  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1875  putative lipoprotein  63.79 
 
 		 116 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2936  putative lipoprotein  62.5 
 
 		 115 aa  150  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2728  putative lipoprotein  62.28 
 
 		 115 aa  150  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3027  hypothetical protein  62.28 
 
 		 115 aa  150  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2617  putative lipoprotein  64.29 
 
 		 115 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2650  putative lipoprotein  62.93 
 
 		 116 aa  148  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.134828 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1475  hypothetical protein  63.48 
 
 		 116 aa  146  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1482  hypothetical protein  62.5 
 
 		 115 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31230  hypothetical protein  64.35 
 
 		 175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000641802  unclonable  1.55201e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1250  hypothetical protein  62.07 
 
 		 193 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1259  putative lipoprotein  64.29 
 
 		 109 aa  143  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0677  hypothetical protein  62.61 
 
 		 116 aa  142  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2081  hypothetical protein  65.22 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3536  hypothetical protein  60 
 
 		 116 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3735  hypothetical protein  62.93 
 
 		 116 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3668  hypothetical protein  58.56 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2609  lipoprotein  62.07 
 
 		 197 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.707585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1501  putative lipoprotein  57.02 
 
 		 116 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1041  hypothetical protein  66.33 
 
 		 118 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0599  hypothetical protein  52.21 
 
 		 115 aa  114  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2083  putative lipoprotein  54.95 
 
 		 113 aa  114  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0080  hypothetical protein  43.75 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2663  hypothetical protein  48.72 
 
 		 135 aa  90.5  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.996553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2122  hypothetical protein  48.18 
 
 		 123 aa  88.6  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3815  hypothetical protein  49.09 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0782579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7395  hypothetical protein  48.18 
 
 		 123 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1543  hypothetical protein  50 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0356843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2521  hypothetical protein  51.65 
 
 		 203 aa  87  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0794  hypothetical protein  51 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.544524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7704  hypothetical protein  46.36 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2010  hypothetical protein  48.08 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0162  hypothetical protein  42.86 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3150  hypothetical protein  43.64 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0353  hypothetical protein  45.05 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239332  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1116  hypothetical protein  44.33 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000322507  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4449  hypothetical protein  44.23 
 
 		 266 aa  42.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000448491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>