48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_36010 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_36010  lipoprotein  100 
 
 
118 aa  239  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0460  putative lipoprotein  77.39 
 
 
115 aa  184  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552227  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1482  hypothetical protein  75.65 
 
 
115 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0683  putative lipoprotein  74.58 
 
 
160 aa  180  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2326  putative lipoprotein  75.44 
 
 
116 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3027  hypothetical protein  73.04 
 
 
115 aa  176  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2728  putative lipoprotein  73.04 
 
 
115 aa  176  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31150  hypothetical protein  77.68 
 
 
133 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000059754  unclonable  1.00757e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1285  putative lipoprotein  73.68 
 
 
116 aa  173  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2617  putative lipoprotein  72.17 
 
 
115 aa  173  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143541  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3529  putative lipoprotein  74.34 
 
 
116 aa  173  8e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348818  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1875  putative lipoprotein  72.81 
 
 
116 aa  171  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2650  putative lipoprotein  72.81 
 
 
116 aa  169  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.134828 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2936  putative lipoprotein  70.43 
 
 
115 aa  169  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377155  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1250  hypothetical protein  73.45 
 
 
193 aa  167  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1259  putative lipoprotein  70.43 
 
 
109 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3735  hypothetical protein  77.88 
 
 
116 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4163  putative lipoprotein  67.86 
 
 
116 aa  154  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2609  lipoprotein  76.99 
 
 
197 aa  154  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.707585  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2083  putative lipoprotein  51.35 
 
 
113 aa  110  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1274  putative transposon  51.79 
 
 
116 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3668  hypothetical protein  48.28 
 
 
118 aa  107  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0470  hypothetical protein  51.35 
 
 
116 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3038  hypothetical protein  50 
 
 
116 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2608  hypothetical protein  50 
 
 
116 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2738  hypothetical protein  49.11 
 
 
116 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460975  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1475  hypothetical protein  48.67 
 
 
116 aa  102  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1041  hypothetical protein  56.12 
 
 
118 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1501  putative lipoprotein  50 
 
 
116 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31230  hypothetical protein  50 
 
 
175 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000641802  unclonable  1.55201e-22 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0677  hypothetical protein  49.11 
 
 
116 aa  99  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.759632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2081  hypothetical protein  48.67 
 
 
113 aa  97.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3536  hypothetical protein  45.54 
 
 
116 aa  95.9  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0599  hypothetical protein  41.59 
 
 
115 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2122  hypothetical protein  45.45 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7704  hypothetical protein  43.64 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0707762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7395  hypothetical protein  41.07 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1543  hypothetical protein  42.86 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0356843 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0162  hypothetical protein  38.26 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0080  hypothetical protein  37.39 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2663  hypothetical protein  41.88 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.996553  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2521  hypothetical protein  45.98 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124259  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3815  hypothetical protein  41.82 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0782579  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0794  hypothetical protein  42 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.544524 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3150  hypothetical protein  39.09 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2010  hypothetical protein  38.46 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636373  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0353  hypothetical protein  39.56 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239332  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1116  hypothetical protein  36.84 
 
 
97 aa  52  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000322507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>