49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1274 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1274  putative transposon  100 
 
 		 116 aa  236  8e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1475  hypothetical protein  91.3 
 
 		 116 aa  218  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2608  hypothetical protein  90.43 
 
 		 116 aa  216  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3038  hypothetical protein  90.43 
 
 		 116 aa  216  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2738  hypothetical protein  89.57 
 
 		 116 aa  214  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0470  hypothetical protein  92.11 
 
 		 116 aa  215  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3536  hypothetical protein  88.7 
 
 		 116 aa  211  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31230  hypothetical protein  88.7 
 
 		 175 aa  209  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000641802  unclonable  1.55201e-22 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0677  hypothetical protein  86.09 
 
 		 116 aa  201  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2081  hypothetical protein  74.77 
 
 		 113 aa  164  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4163  putative lipoprotein  66.09 
 
 		 116 aa  155  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3668  hypothetical protein  62.16 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0599  hypothetical protein  57.89 
 
 		 115 aa  124  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1501  putative lipoprotein  53.91 
 
 		 116 aa  120  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1041  hypothetical protein  65.18 
 
 		 118 aa  119  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3529  putative lipoprotein  53.04 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348818  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0683  putative lipoprotein  50.43 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36010  lipoprotein  51.79 
 
 		 118 aa  110  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0080  hypothetical protein  50.89 
 
 		 132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0460  putative lipoprotein  50.44 
 
 		 115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2326  putative lipoprotein  50.43 
 
 		 116 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2617  putative lipoprotein  49.56 
 
 		 115 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31150  hypothetical protein  50.46 
 
 		 133 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000059754  unclonable  1.00757e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1259  putative lipoprotein  52.25 
 
 		 109 aa  105  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2936  putative lipoprotein  47.79 
 
 		 115 aa  104  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1285  putative lipoprotein  50.88 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3027  hypothetical protein  46.9 
 
 		 115 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2728  putative lipoprotein  46.9 
 
 		 115 aa  103  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1875  putative lipoprotein  50 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2083  putative lipoprotein  51.82 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1482  hypothetical protein  47.79 
 
 		 115 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0162  hypothetical protein  50.89 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2650  putative lipoprotein  49.12 
 
 		 116 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.134828 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1250  hypothetical protein  49.12 
 
 		 193 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3735  hypothetical protein  49.12 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2609  lipoprotein  48.7 
 
 		 197 aa  95.5  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.707585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2521  hypothetical protein  55.68 
 
 		 203 aa  87.4  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2663  hypothetical protein  45.3 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.996553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3815  hypothetical protein  49.09 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0782579  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0353  hypothetical protein  42.45 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239332  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7395  hypothetical protein  48.18 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1543  hypothetical protein  47.27 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0356843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2010  hypothetical protein  47.27 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2122  hypothetical protein  45.45 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0794  hypothetical protein  46 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.544524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7704  hypothetical protein  45.45 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707762 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3150  hypothetical protein  43.64 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1116  hypothetical protein  46.97 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000322507  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4449  hypothetical protein  49.12 
 
 		 266 aa  52  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000448491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>