50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_31230 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_31230  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  352  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000641802  unclonable  1.55201e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1475  hypothetical protein  88.79 
 
 		 116 aa  213  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1274  putative transposon  88.7 
 
 		 116 aa  209  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0677  hypothetical protein  90.43 
 
 		 116 aa  209  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759632 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2608  hypothetical protein  87.07 
 
 		 116 aa  208  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3038  hypothetical protein  87.07 
 
 		 116 aa  208  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3536  hypothetical protein  86.21 
 
 		 116 aa  207  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2738  hypothetical protein  86.21 
 
 		 116 aa  207  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0470  hypothetical protein  87.07 
 
 		 116 aa  204  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2081  hypothetical protein  73.87 
 
 		 113 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4163  putative lipoprotein  64.35 
 
 		 116 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3668  hypothetical protein  62.16 
 
 		 118 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0599  hypothetical protein  61.61 
 
 		 115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1501  putative lipoprotein  56.9 
 
 		 116 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1041  hypothetical protein  63.27 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0683  putative lipoprotein  48.76 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0080  hypothetical protein  52.25 
 
 		 132 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3529  putative lipoprotein  50.43 
 
 		 116 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348818  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0162  hypothetical protein  53.15 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2936  putative lipoprotein  49.56 
 
 		 115 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2326  putative lipoprotein  49.57 
 
 		 116 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2617  putative lipoprotein  49.56 
 
 		 115 aa  101  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31150  hypothetical protein  46.77 
 
 		 133 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000059754  unclonable  1.00757e-22 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36010  lipoprotein  50 
 
 		 118 aa  99.8  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0460  putative lipoprotein  49.56 
 
 		 115 aa  99.8  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1250  hypothetical protein  49.57 
 
 		 193 aa  99.4  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2083  putative lipoprotein  51.35 
 
 		 113 aa  99  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2728  putative lipoprotein  46.9 
 
 		 115 aa  98.2  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3027  hypothetical protein  46.9 
 
 		 115 aa  98.2  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1285  putative lipoprotein  49.12 
 
 		 116 aa  96.7  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2650  putative lipoprotein  49.12 
 
 		 116 aa  97.1  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.134828 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1875  putative lipoprotein  49.12 
 
 		 116 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1259  putative lipoprotein  47.79 
 
 		 109 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1482  hypothetical protein  47.79 
 
 		 115 aa  95.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2609  lipoprotein  48.25 
 
 		 197 aa  92.4  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.707585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3735  hypothetical protein  47.37 
 
 		 116 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2521  hypothetical protein  55.06 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2663  hypothetical protein  47.86 
 
 		 135 aa  84.7  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.996553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3815  hypothetical protein  48.65 
 
 		 123 aa  84  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0782579  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0353  hypothetical protein  44.76 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239332  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7395  hypothetical protein  48.65 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2010  hypothetical protein  47.75 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1543  hypothetical protein  48.65 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0356843 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2122  hypothetical protein  45.95 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0794  hypothetical protein  45.54 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.544524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7704  hypothetical protein  46.85 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707762 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3150  hypothetical protein  43.36 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1116  hypothetical protein  52.31 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000322507  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4449  hypothetical protein  35.25 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000448491 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4214  hypothetical protein  36.71 
 
 		 340 aa  41.2  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>