46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1116 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1116  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  192  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000322507  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3668  hypothetical protein  53.85 
 
 		 118 aa  67  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3815  hypothetical protein  45.45 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0782579  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1041  hypothetical protein  45.65 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4163  putative lipoprotein  44.33 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7395  hypothetical protein  44.94 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0794  hypothetical protein  43.18 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.544524 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2122  hypothetical protein  43.18 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2010  hypothetical protein  49.18 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2521  hypothetical protein  49.23 
 
 		 203 aa  60.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31230  hypothetical protein  52.31 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000641802  unclonable  1.55201e-22 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0677  hypothetical protein  53.12 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759632 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7704  hypothetical protein  43.18 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707762 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2663  hypothetical protein  41.41 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.996553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3150  hypothetical protein  38.64 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4449  hypothetical protein  41.18 
 
 		 266 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000448491 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1475  hypothetical protein  51.56 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1543  hypothetical protein  39.77 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0356843 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2608  hypothetical protein  48.44 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3536  hypothetical protein  51.56 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3038  hypothetical protein  48.44 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1274  putative transposon  46.97 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1501  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0470  hypothetical protein  49.23 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2617  putative lipoprotein  40.79 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3529  putative lipoprotein  40.79 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348818  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2081  hypothetical protein  49.21 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2738  hypothetical protein  46.88 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0460  putative lipoprotein  42.11 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2326  putative lipoprotein  34.38 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36010  lipoprotein  36.84 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2650  putative lipoprotein  36.36 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.134828 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0683  putative lipoprotein  36.84 
 
 		 160 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1875  putative lipoprotein  36.36 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1250  hypothetical protein  35.06 
 
 		 193 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1285  putative lipoprotein  36.36 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31150  hypothetical protein  38.16 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000059754  unclonable  1.00757e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2936  putative lipoprotein  39.47 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2728  putative lipoprotein  38.16 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3027  hypothetical protein  38.16 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1259  putative lipoprotein  35.9 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3735  hypothetical protein  36.99 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2609  lipoprotein  37.84 
 
 		 197 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.707585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1482  hypothetical protein  35.71 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2083  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0162  hypothetical protein  34.33 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>