49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0677 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0677  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  234  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.759632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31230  hypothetical protein  90.43 
 
 
175 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000641802  unclonable  1.55201e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1274  putative transposon  86.09 
 
 
116 aa  201  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2608  hypothetical protein  85.22 
 
 
116 aa  201  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3038  hypothetical protein  85.22 
 
 
116 aa  201  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2738  hypothetical protein  84.35 
 
 
116 aa  200  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460975  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0470  hypothetical protein  85.96 
 
 
116 aa  197  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1475  hypothetical protein  84.35 
 
 
116 aa  197  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3536  hypothetical protein  81.74 
 
 
116 aa  191  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2081  hypothetical protein  70.54 
 
 
113 aa  150  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4163  putative lipoprotein  62.61 
 
 
116 aa  142  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3668  hypothetical protein  57.66 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0599  hypothetical protein  59.65 
 
 
115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1501  putative lipoprotein  53.91 
 
 
116 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1041  hypothetical protein  63.27 
 
 
118 aa  114  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3529  putative lipoprotein  48.7 
 
 
116 aa  104  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348818  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0683  putative lipoprotein  46.96 
 
 
160 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0080  hypothetical protein  49.55 
 
 
132 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2326  putative lipoprotein  48.7 
 
 
116 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2936  putative lipoprotein  48.67 
 
 
115 aa  100  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377155  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2617  putative lipoprotein  48.67 
 
 
115 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143541  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2650  putative lipoprotein  49.12 
 
 
116 aa  98.6  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.134828 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0460  putative lipoprotein  48.67 
 
 
115 aa  99  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552227  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31150  hypothetical protein  47.71 
 
 
133 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000059754  unclonable  1.00757e-22 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36010  lipoprotein  49.11 
 
 
118 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0162  hypothetical protein  51.35 
 
 
121 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1285  putative lipoprotein  49.12 
 
 
116 aa  98.2  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1875  putative lipoprotein  49.12 
 
 
116 aa  98.2  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1250  hypothetical protein  49.12 
 
 
193 aa  97.4  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2728  putative lipoprotein  46.02 
 
 
115 aa  96.7  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3027  hypothetical protein  46.02 
 
 
115 aa  96.7  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1482  hypothetical protein  46.9 
 
 
115 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1259  putative lipoprotein  47.75 
 
 
109 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2083  putative lipoprotein  48.21 
 
 
113 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2521  hypothetical protein  55.68 
 
 
203 aa  89.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124259  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3735  hypothetical protein  46.49 
 
 
116 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2609  lipoprotein  46.09 
 
 
197 aa  88.6  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.707585  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2663  hypothetical protein  46.55 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.996553  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3815  hypothetical protein  49.11 
 
 
123 aa  82  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0782579  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0353  hypothetical protein  50 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239332  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2010  hypothetical protein  49.04 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636373  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7395  hypothetical protein  47.27 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1543  hypothetical protein  46.36 
 
 
131 aa  73.6  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0356843 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2122  hypothetical protein  44.64 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0794  hypothetical protein  45 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.544524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7704  hypothetical protein  45.54 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0707762 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3150  hypothetical protein  42.86 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1116  hypothetical protein  53.12 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000322507  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4449  hypothetical protein  52.63 
 
 
266 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000448491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>