48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1482 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1482  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  229  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0460  putative lipoprotein  91.3 
 
 		 115 aa  211  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2617  putative lipoprotein  82.61 
 
 		 115 aa  197  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2936  putative lipoprotein  81.74 
 
 		 115 aa  192  9e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3027  hypothetical protein  80 
 
 		 115 aa  192  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2728  putative lipoprotein  80 
 
 		 115 aa  192  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36010  lipoprotein  75.65 
 
 		 118 aa  182  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0683  putative lipoprotein  75.89 
 
 		 160 aa  177  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3529  putative lipoprotein  75.89 
 
 		 116 aa  174  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348818  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31150  hypothetical protein  73.45 
 
 		 133 aa  174  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000059754  unclonable  1.00757e-22 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2326  putative lipoprotein  75 
 
 		 116 aa  169  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1285  putative lipoprotein  74.11 
 
 		 116 aa  169  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1250  hypothetical protein  74.11 
 
 		 193 aa  167  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1875  putative lipoprotein  73.21 
 
 		 116 aa  167  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1259  putative lipoprotein  71.3 
 
 		 109 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2650  putative lipoprotein  74.77 
 
 		 116 aa  163  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.134828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3735  hypothetical protein  75 
 
 		 116 aa  157  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2609  lipoprotein  74.11 
 
 		 197 aa  154  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.707585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4163  putative lipoprotein  62.5 
 
 		 116 aa  145  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2083  putative lipoprotein  50.91 
 
 		 113 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3668  hypothetical protein  45.54 
 
 		 118 aa  100  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1274  putative transposon  47.79 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2608  hypothetical protein  47.83 
 
 		 116 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3038  hypothetical protein  47.83 
 
 		 116 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1041  hypothetical protein  52.53 
 
 		 118 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2738  hypothetical protein  46.96 
 
 		 116 aa  98.2  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1501  putative lipoprotein  51.82 
 
 		 116 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0470  hypothetical protein  47.27 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1475  hypothetical protein  45.61 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31230  hypothetical protein  47.79 
 
 		 175 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000641802  unclonable  1.55201e-22 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0677  hypothetical protein  46.9 
 
 		 116 aa  94  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2081  hypothetical protein  44.74 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3536  hypothetical protein  47.12 
 
 		 116 aa  88.6  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0599  hypothetical protein  44.25 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2122  hypothetical protein  44.55 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7704  hypothetical protein  42.73 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707762 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0353  hypothetical protein  35.9 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239332  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2663  hypothetical protein  39.32 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.996553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7395  hypothetical protein  38.18 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2521  hypothetical protein  41.94 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3815  hypothetical protein  39.09 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0782579  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0080  hypothetical protein  37.5 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1543  hypothetical protein  38.39 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0356843 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0162  hypothetical protein  36.52 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0794  hypothetical protein  38 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.544524 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3150  hypothetical protein  36.36 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2010  hypothetical protein  36.54 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1116  hypothetical protein  35.71 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000322507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>