119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1855 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1855  protein of unknown function DUF1006  100 
 
 		 365 aa  734    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2290  hypothetical protein  80.39 
 
 		 365 aa  580  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000676004 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2127  hypothetical protein  75.9 
 
 		 370 aa  570  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4021  hypothetical protein  61.84 
 
 		 365 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0125  hypothetical protein  56.08 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0129878 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1661  hypothetical protein  48.02 
 
 		 382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.874726  normal  0.124074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2950  hypothetical protein  29.77 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1435  hypothetical protein  26.9 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434806  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00920  hypothetical protein  27.48 
 
 		 410 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0550337  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2727  protein of unknown function DUF1006  27.48 
 
 		 410 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1023  hypothetical protein  27.48 
 
 		 410 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0437357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2680  hypothetical protein  27.48 
 
 		 410 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.309321  normal  0.302456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0992  hypothetical protein  27.76 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789138  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00927  hypothetical protein  27.48 
 
 		 410 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1014  hypothetical protein  27.56 
 
 		 410 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00266491  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1100  hypothetical protein  28.39 
 
 		 410 aa  96.3  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4016  hypothetical protein  28.71 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2204  hypothetical protein  27.56 
 
 		 410 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0443538  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3917  protein of unknown function DUF1006  28.35 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1051  hypothetical protein  27.44 
 
 		 410 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2408  hypothetical protein  27.24 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173137  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1077  hypothetical protein  27.94 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00717119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3101  hypothetical protein  27.16 
 
 		 394 aa  93.2  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0111647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3994  hypothetical protein  27.67 
 
 		 390 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1019  hypothetical protein  27.44 
 
 		 410 aa  92.8  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.871139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1084  hypothetical protein  27.88 
 
 		 410 aa  92.8  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.048603  normal  0.227981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2209  hypothetical protein  26.2 
 
 		 404 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.266016  normal  0.263696 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4914  hypothetical protein  27.5 
 
 		 392 aa  90.9  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4110  hypothetical protein  27.73 
 
 		 390 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0367  hypothetical protein  28.04 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1587  hypothetical protein  30.77 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447524 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1169  hypothetical protein  31.21 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0372  hypothetical protein  27.1 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1548  hypothetical protein  31.21 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2233  hypothetical protein  31.21 
 
 		 444 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0071  hypothetical protein  31.21 
 
 		 444 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0046059  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0990  hypothetical protein  31.21 
 
 		 444 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.64376  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0902  hypothetical protein  31.21 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3654  hypothetical protein  27.41 
 
 		 388 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0292  hypothetical protein  27.87 
 
 		 398 aa  86.3  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3840  hypothetical protein  27.41 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4332  hypothetical protein  27.55 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0891  protein of unknown function DUF1006  27.12 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1922  protein of unknown function DUF1006  26.57 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.465239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2043  hypothetical protein  27.6 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0040  hypothetical protein  29.41 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2506  protein of unknown function DUF1006  28.93 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2912  hypothetical protein  26.29 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.260325  normal  0.218883 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2793  hypothetical protein  28.66 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.585867  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3498  hypothetical protein  28.86 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4868  hypothetical protein  28.86 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25310  hypothetical protein  27.16 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5418  hypothetical protein  29.69 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3685  hypothetical protein  28.22 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1386  hypothetical protein  29.09 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1754  hypothetical protein  29.39 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3291  hypothetical protein  25 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.19754  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4263  hypothetical protein  28.1 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0847  hypothetical protein  29.3 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1439  hypothetical protein  25.55 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3033  hypothetical protein  30.1 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4239  hypothetical protein  29.15 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  normal  0.240399 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1717  hypothetical protein  25.14 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3732  hypothetical protein  29.63 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.106276  normal  0.539223 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4762  hypothetical protein  29.15 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2989  hypothetical protein  27.44 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2155  hypothetical protein  23.84 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0997  hypothetical protein  26.36 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.728779  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2789  hypothetical protein  26.5 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2707  hypothetical protein  28.1 
 
 		 419 aa  76.3  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.288749  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08640  hypothetical protein  28.31 
 
 		 441 aa  76.3  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00452751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2334  hypothetical protein  28.99 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1344  hypothetical protein  28.25 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.471387  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1866  hypothetical protein  22.4 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.908975  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1058  protein of unknown function DUF1006  27.61 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.338087  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4161  protein of unknown function DUF1006  27.58 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0215  protein of unknown function DUF1006  26.1 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1010  hypothetical protein  25.61 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2114  hypothetical protein  28.03 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.408029  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2160  hypothetical protein  28.03 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2101  hypothetical protein  28.03 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1440  hypothetical protein  26.46 
 
 		 405 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2233  hypothetical protein  31.31 
 
 		 407 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00963796 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1381  hypothetical protein  29.1 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0049  hypothetical protein  29.1 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1055  hypothetical protein  26.4 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4005  hypothetical protein  29.85 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0454091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4678  hypothetical protein  28.83 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2834  hypothetical protein  28.44 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0625  protein of unknown function DUF1006  24.23 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.045012 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1245  protein of unknown function DUF1006  27.43 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5817  protein of unknown function DUF1006  26.18 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2519  hypothetical protein  24.44 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0874  hypothetical protein  41.24 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4037  protein of unknown function DUF1006  27.51 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0254  hypothetical protein  28.2 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27310  hypothetical protein  29.45 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0584  protein of unknown function DUF1006  36.54 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2438  protein of unknown function DUF1006  26.94 
 
 		 413 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1418  hypothetical protein  28.98 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0272314 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>