119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1058 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0997  hypothetical protein  95.45 
 
 
397 aa  737    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.728779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2834  hypothetical protein  84.05 
 
 
410 aa  641    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1055  hypothetical protein  97.23 
 
 
397 aa  751    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1058  protein of unknown function DUF1006  100 
 
 
397 aa  769    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.338087  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1866  hypothetical protein  28.41 
 
 
399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.908975  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0292  hypothetical protein  31.52 
 
 
398 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2155  hypothetical protein  26.7 
 
 
371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2912  hypothetical protein  28.31 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.260325  normal  0.218883 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3033  hypothetical protein  30 
 
 
405 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1587  hypothetical protein  29.85 
 
 
402 aa  123  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.447524 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1381  hypothetical protein  30 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1169  hypothetical protein  30.77 
 
 
409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2233  hypothetical protein  30.77 
 
 
444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0071  hypothetical protein  30.77 
 
 
444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0046059  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0049  hypothetical protein  30 
 
 
406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130826  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0990  hypothetical protein  30.77 
 
 
444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.64376  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0902  hypothetical protein  30.77 
 
 
416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1548  hypothetical protein  30.77 
 
 
409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1010  hypothetical protein  30.05 
 
 
397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4239  hypothetical protein  28.72 
 
 
403 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  normal  0.240399 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0040  hypothetical protein  29.16 
 
 
404 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0504  hypothetical protein  29.13 
 
 
399 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0989166  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0847  hypothetical protein  27.95 
 
 
403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5418  hypothetical protein  28.3 
 
 
403 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1754  hypothetical protein  30.35 
 
 
423 aa  113  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4868  hypothetical protein  28.3 
 
 
403 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4263  hypothetical protein  27.66 
 
 
404 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3498  hypothetical protein  28.06 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281195  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4762  hypothetical protein  27.9 
 
 
403 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4037  protein of unknown function DUF1006  31.9 
 
 
398 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0584  protein of unknown function DUF1006  27.96 
 
 
411 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2989  hypothetical protein  27.7 
 
 
416 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0625  protein of unknown function DUF1006  27.82 
 
 
396 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.045012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1418  hypothetical protein  30.83 
 
 
393 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0272314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2789  hypothetical protein  30.77 
 
 
362 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1435  hypothetical protein  27.44 
 
 
409 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434806  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3685  hypothetical protein  30.41 
 
 
371 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319245  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3948  protein of unknown function DUF1006  33.52 
 
 
403 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751345  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2141  hypothetical protein  27.11 
 
 
406 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129516  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0891  protein of unknown function DUF1006  26.51 
 
 
388 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2233  hypothetical protein  31.34 
 
 
407 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00963796 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4016  hypothetical protein  29.11 
 
 
389 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1487  protein of unknown function DUF1006  30.73 
 
 
415 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.839829  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08640  hypothetical protein  33.88 
 
 
441 aa  100  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00452751  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3732  hypothetical protein  27.12 
 
 
466 aa  100  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.106276  normal  0.539223 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3917  protein of unknown function DUF1006  29.34 
 
 
390 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1344  hypothetical protein  31.91 
 
 
409 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.471387  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2950  hypothetical protein  26.87 
 
 
401 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4110  hypothetical protein  29.34 
 
 
390 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2793  hypothetical protein  31.23 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.585867  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1386  hypothetical protein  31.67 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1717  hypothetical protein  24.38 
 
 
408 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1084  hypothetical protein  25.88 
 
 
410 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.048603  normal  0.227981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3994  hypothetical protein  28.25 
 
 
390 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1051  hypothetical protein  25.69 
 
 
410 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1019  hypothetical protein  25.44 
 
 
410 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.871139 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2326  protein of unknown function DUF1006  33.05 
 
 
428 aa  94.4  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.193329  hitchhiker  0.00000627323 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1439  hypothetical protein  33.59 
 
 
399 aa  93.6  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4914  hypothetical protein  25.65 
 
 
392 aa  93.6  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0992  hypothetical protein  25.44 
 
 
410 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789138  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2043  hypothetical protein  27.38 
 
 
387 aa  93.6  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3506  protein of unknown function DUF1006  30.71 
 
 
359 aa  93.2  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal  0.204168 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1021  hypothetical protein  31.29 
 
 
442 aa  92.8  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1014  hypothetical protein  24.69 
 
 
410 aa  92  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00266491  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1440  hypothetical protein  30.51 
 
 
405 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.179027 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1100  hypothetical protein  25.44 
 
 
410 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00920  hypothetical protein  24.86 
 
 
410 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0550337  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2727  protein of unknown function DUF1006  24.86 
 
 
410 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1023  hypothetical protein  24.86 
 
 
410 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0437357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2680  hypothetical protein  24.86 
 
 
410 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.309321  normal  0.302456 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00927  hypothetical protein  24.86 
 
 
410 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4678  hypothetical protein  29.94 
 
 
415 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27310  hypothetical protein  30.09 
 
 
402 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25310  hypothetical protein  30.64 
 
 
402 aa  90.9  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104816  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0372  hypothetical protein  28.21 
 
 
388 aa  90.1  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2408  hypothetical protein  24.44 
 
 
410 aa  90.1  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173137  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1077  hypothetical protein  24.86 
 
 
410 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00717119  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2311  hypothetical protein  30.3 
 
 
402 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0254  hypothetical protein  29.95 
 
 
403 aa  89.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3654  hypothetical protein  27.9 
 
 
388 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0874  hypothetical protein  32.51 
 
 
494 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2204  hypothetical protein  24.86 
 
 
410 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0443538  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2230  protein of unknown function DUF1006  29.71 
 
 
437 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00678706  normal  0.39065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3991  hypothetical protein  29.05 
 
 
406 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0568557  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0367  hypothetical protein  29.57 
 
 
388 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3840  hypothetical protein  25.21 
 
 
402 aa  86.7  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3291  hypothetical protein  23.72 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.19754  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2519  hypothetical protein  27.34 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1245  protein of unknown function DUF1006  30.11 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09390  hypothetical protein  30.03 
 
 
449 aa  83.6  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2127  hypothetical protein  28.7 
 
 
370 aa  83.2  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187973  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3809  protein of unknown function DUF1006  29.95 
 
 
428 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7587  protein of unknown function DUF1006  28.02 
 
 
401 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4332  hypothetical protein  27.39 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2745  hypothetical protein  30.85 
 
 
450 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3101  hypothetical protein  31.7 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0111647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6004  protein of unknown function DUF1006  23.43 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4161  protein of unknown function DUF1006  28.89 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1855  protein of unknown function DUF1006  27.61 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2137  hypothetical protein  29.33 
 
 
397 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387118  normal  0.200315 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>