120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2793 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2793  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  770    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.585867  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1021  hypothetical protein  54.66 
 
 		 442 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2745  hypothetical protein  53.44 
 
 		 450 aa  360  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0874  hypothetical protein  56.73 
 
 		 494 aa  358  8e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4678  hypothetical protein  53.91 
 
 		 415 aa  358  9e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3991  hypothetical protein  50 
 
 		 406 aa  343  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0568557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2137  hypothetical protein  53.15 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387118  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27310  hypothetical protein  51.51 
 
 		 402 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1344  hypothetical protein  51.82 
 
 		 409 aa  329  4e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.471387  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1386  hypothetical protein  51.56 
 
 		 410 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2311  hypothetical protein  50.68 
 
 		 402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2233  hypothetical protein  49.87 
 
 		 407 aa  319  6e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00963796 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1440  hypothetical protein  49.21 
 
 		 405 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3948  protein of unknown function DUF1006  52.73 
 
 		 403 aa  312  5.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751345  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2230  protein of unknown function DUF1006  48.37 
 
 		 437 aa  306  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00678706  normal  0.39065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1487  protein of unknown function DUF1006  48.29 
 
 		 415 aa  306  6e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.839829  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5817  protein of unknown function DUF1006  46.25 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0254  hypothetical protein  47.93 
 
 		 403 aa  301  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1245  protein of unknown function DUF1006  48.57 
 
 		 402 aa  292  9e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2114  hypothetical protein  46.13 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.408029  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2160  hypothetical protein  46.13 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2101  hypothetical protein  46.13 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25310  hypothetical protein  47.68 
 
 		 402 aa  288  8e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2383  hypothetical protein  45.9 
 
 		 411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1439  hypothetical protein  46.99 
 
 		 399 aa  282  8.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4161  protein of unknown function DUF1006  45.48 
 
 		 410 aa  278  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09390  hypothetical protein  45.36 
 
 		 449 aa  269  7e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2506  protein of unknown function DUF1006  47.26 
 
 		 432 aa  269  8e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2178  protein of unknown function DUF1006  44.27 
 
 		 405 aa  263  4.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0894298  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4005  hypothetical protein  44.21 
 
 		 408 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0454091 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08640  hypothetical protein  44.39 
 
 		 441 aa  259  8e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00452751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3809  protein of unknown function DUF1006  46.43 
 
 		 428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2438  protein of unknown function DUF1006  41.73 
 
 		 413 aa  235  9e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2707  hypothetical protein  41.58 
 
 		 419 aa  234  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.288749  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2326  protein of unknown function DUF1006  44.41 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.193329  hitchhiker  0.00000627323 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0215  protein of unknown function DUF1006  39.9 
 
 		 385 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4037  protein of unknown function DUF1006  41.65 
 
 		 398 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0891  protein of unknown function DUF1006  35.79 
 
 		 388 aa  212  9e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1587  hypothetical protein  38.65 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447524 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2233  hypothetical protein  38.23 
 
 		 444 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0071  hypothetical protein  38.23 
 
 		 444 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0046059  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0990  hypothetical protein  38.23 
 
 		 444 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.64376  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1169  hypothetical protein  38.23 
 
 		 409 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0902  hypothetical protein  38.23 
 
 		 416 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1548  hypothetical protein  38.23 
 
 		 409 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1754  hypothetical protein  37.67 
 
 		 423 aa  205  9e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1418  hypothetical protein  39.3 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0272314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7587  protein of unknown function DUF1006  38.44 
 
 		 401 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2989  hypothetical protein  37.28 
 
 		 416 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2950  hypothetical protein  36.27 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4263  hypothetical protein  37.46 
 
 		 404 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1051  hypothetical protein  37.05 
 
 		 410 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1100  hypothetical protein  37.05 
 
 		 410 aa  195  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1019  hypothetical protein  36.77 
 
 		 410 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.871139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0992  hypothetical protein  37.05 
 
 		 410 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789138  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4762  hypothetical protein  35.58 
 
 		 403 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0292  hypothetical protein  40.25 
 
 		 398 aa  192  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1717  hypothetical protein  34.81 
 
 		 408 aa  192  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1084  hypothetical protein  36.49 
 
 		 410 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.048603  normal  0.227981 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0847  hypothetical protein  37.24 
 
 		 403 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4239  hypothetical protein  35.04 
 
 		 403 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  normal  0.240399 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3498  hypothetical protein  34.41 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4868  hypothetical protein  34.41 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5418  hypothetical protein  34.66 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4110  hypothetical protein  35.06 
 
 		 390 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1435  hypothetical protein  34.99 
 
 		 409 aa  186  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3840  hypothetical protein  33.33 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3917  protein of unknown function DUF1006  35.06 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3732  hypothetical protein  34.77 
 
 		 466 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.106276  normal  0.539223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3033  hypothetical protein  36.21 
 
 		 405 aa  182  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3994  hypothetical protein  33.42 
 
 		 390 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4016  hypothetical protein  34.77 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0372  hypothetical protein  34.34 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0040  hypothetical protein  36.83 
 
 		 404 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1010  hypothetical protein  36.56 
 
 		 397 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3291  hypothetical protein  34.84 
 
 		 399 aa  177  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.19754  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3101  hypothetical protein  35.6 
 
 		 394 aa  176  8e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0111647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4914  hypothetical protein  33.53 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2912  hypothetical protein  36.36 
 
 		 406 aa  172  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.260325  normal  0.218883 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4332  hypothetical protein  35.08 
 
 		 388 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1014  hypothetical protein  33.33 
 
 		 410 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00266491  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3654  hypothetical protein  33.13 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0367  hypothetical protein  34.85 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0504  hypothetical protein  33.33 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0989166  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00920  hypothetical protein  33.08 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0550337  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2727  protein of unknown function DUF1006  33.08 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1381  hypothetical protein  38.2 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1023  hypothetical protein  33.08 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0437357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2680  hypothetical protein  33.08 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.309321  normal  0.302456 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2204  hypothetical protein  33.75 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0443538  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00927  hypothetical protein  33.08 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0049  hypothetical protein  38.2 
 
 		 406 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2408  hypothetical protein  33.08 
 
 		 410 aa  170  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173137  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1077  hypothetical protein  33.08 
 
 		 410 aa  170  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00717119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2141  hypothetical protein  35.41 
 
 		 406 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129516  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0584  protein of unknown function DUF1006  32.71 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0625  protein of unknown function DUF1006  34.04 
 
 		 396 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.045012 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2519  hypothetical protein  32.78 
 
 		 389 aa  159  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6004  protein of unknown function DUF1006  27.51 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1922  protein of unknown function DUF1006  32.96 
 
 		 380 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.465239 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>