120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3506 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3506  protein of unknown function DUF1006  100 
 
 
359 aa  706    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal  0.204168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2789  hypothetical protein  62.99 
 
 
362 aa  437  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2334  hypothetical protein  52.46 
 
 
368 aa  332  6e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2950  hypothetical protein  37.61 
 
 
401 aa  173  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1435  hypothetical protein  32.64 
 
 
409 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434806  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4762  hypothetical protein  34.64 
 
 
403 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4263  hypothetical protein  34.96 
 
 
404 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2989  hypothetical protein  34.02 
 
 
416 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4239  hypothetical protein  34.64 
 
 
403 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  normal  0.240399 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2137  hypothetical protein  35.99 
 
 
397 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387118  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0847  hypothetical protein  34.25 
 
 
403 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1717  hypothetical protein  31.63 
 
 
408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3498  hypothetical protein  32.82 
 
 
403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281195  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5418  hypothetical protein  32.82 
 
 
403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4868  hypothetical protein  32.82 
 
 
403 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27310  hypothetical protein  33.7 
 
 
402 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3732  hypothetical protein  35.64 
 
 
466 aa  133  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.106276  normal  0.539223 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2745  hypothetical protein  32.89 
 
 
450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1754  hypothetical protein  35.17 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1051  hypothetical protein  30.34 
 
 
410 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1169  hypothetical protein  35.7 
 
 
409 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0990  hypothetical protein  35.7 
 
 
444 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.64376  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0902  hypothetical protein  35.7 
 
 
416 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1548  hypothetical protein  35.7 
 
 
409 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2311  hypothetical protein  33.24 
 
 
402 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2233  hypothetical protein  35.7 
 
 
444 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0071  hypothetical protein  35.7 
 
 
444 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0046059  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3991  hypothetical protein  33.77 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0568557  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1100  hypothetical protein  30.08 
 
 
410 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0992  hypothetical protein  30.53 
 
 
410 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789138  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1019  hypothetical protein  29.82 
 
 
410 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.871139 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0891  protein of unknown function DUF1006  29.97 
 
 
388 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1245  protein of unknown function DUF1006  34.47 
 
 
402 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1084  hypothetical protein  29.55 
 
 
410 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.048603  normal  0.227981 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2043  hypothetical protein  29.43 
 
 
387 aa  124  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3948  protein of unknown function DUF1006  34.4 
 
 
403 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751345  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00920  hypothetical protein  30.22 
 
 
410 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0550337  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2727  protein of unknown function DUF1006  30.22 
 
 
410 aa  122  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3033  hypothetical protein  33.53 
 
 
405 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1023  hypothetical protein  30.22 
 
 
410 aa  122  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0437357  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1014  hypothetical protein  30.22 
 
 
410 aa  122  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00266491  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1440  hypothetical protein  33.33 
 
 
405 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.179027 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2680  hypothetical protein  30.22 
 
 
410 aa  122  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.309321  normal  0.302456 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00927  hypothetical protein  30.22 
 
 
410 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2204  hypothetical protein  29.95 
 
 
410 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0443538  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2408  hypothetical protein  29.95 
 
 
410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173137  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0874  hypothetical protein  32.64 
 
 
494 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4161  protein of unknown function DUF1006  32.4 
 
 
410 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1077  hypothetical protein  29.95 
 
 
410 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00717119  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2233  hypothetical protein  32.38 
 
 
407 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00963796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1487  protein of unknown function DUF1006  31.71 
 
 
415 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.839829  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2141  hypothetical protein  33.73 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129516  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0254  hypothetical protein  31.96 
 
 
403 aa  116  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3291  hypothetical protein  29.26 
 
 
399 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.19754  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5817  protein of unknown function DUF1006  31.98 
 
 
406 aa  115  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09390  hypothetical protein  33.59 
 
 
449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2230  protein of unknown function DUF1006  33.51 
 
 
437 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00678706  normal  0.39065 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1021  hypothetical protein  30.73 
 
 
442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0367  hypothetical protein  30.36 
 
 
388 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2793  hypothetical protein  33.25 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.585867  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2506  protein of unknown function DUF1006  31.99 
 
 
432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2438  protein of unknown function DUF1006  32.47 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0372  hypothetical protein  30.23 
 
 
388 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2101  hypothetical protein  30.61 
 
 
404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2912  hypothetical protein  31.94 
 
 
406 aa  110  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.260325  normal  0.218883 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4914  hypothetical protein  28.24 
 
 
392 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2326  protein of unknown function DUF1006  32.89 
 
 
428 aa  109  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.193329  hitchhiker  0.00000627323 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0625  protein of unknown function DUF1006  28.09 
 
 
396 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.045012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2114  hypothetical protein  30.61 
 
 
404 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.408029  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3654  hypothetical protein  28.98 
 
 
388 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2160  hypothetical protein  30.61 
 
 
404 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0215  protein of unknown function DUF1006  30.96 
 
 
385 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1386  hypothetical protein  31.63 
 
 
410 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0292  hypothetical protein  31.32 
 
 
398 aa  107  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1344  hypothetical protein  30.96 
 
 
409 aa  106  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.471387  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4332  hypothetical protein  30.51 
 
 
388 aa  106  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3101  hypothetical protein  32.05 
 
 
394 aa  106  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0111647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4678  hypothetical protein  31.61 
 
 
415 aa  106  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1439  hypothetical protein  30.99 
 
 
399 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4037  protein of unknown function DUF1006  32.75 
 
 
398 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1010  hypothetical protein  28.75 
 
 
397 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1587  hypothetical protein  30.28 
 
 
402 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.447524 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0997  hypothetical protein  31.71 
 
 
397 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.728779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7587  protein of unknown function DUF1006  31.15 
 
 
401 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2519  hypothetical protein  29.01 
 
 
389 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2834  hypothetical protein  32.24 
 
 
410 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4110  hypothetical protein  28.21 
 
 
390 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4016  hypothetical protein  29.41 
 
 
389 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1418  hypothetical protein  31.47 
 
 
393 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0272314 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3994  hypothetical protein  28.61 
 
 
390 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3917  protein of unknown function DUF1006  29.05 
 
 
390 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0040  hypothetical protein  29.83 
 
 
404 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1055  hypothetical protein  30.98 
 
 
397 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1866  hypothetical protein  23.79 
 
 
399 aa  99.8  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.908975  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2707  hypothetical protein  31.81 
 
 
419 aa  99.4  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.288749  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1922  protein of unknown function DUF1006  28.86 
 
 
380 aa  99.4  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.465239 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0584  protein of unknown function DUF1006  26.8 
 
 
411 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25310  hypothetical protein  30.1 
 
 
402 aa  99.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104816  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3840  hypothetical protein  28.74 
 
 
402 aa  98.2  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2178  protein of unknown function DUF1006  29.92 
 
 
405 aa  97.1  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0894298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>