120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2334 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2334  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  719    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2789  hypothetical protein  55.92 
 
 		 362 aa  381  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3506  protein of unknown function DUF1006  52.6 
 
 		 359 aa  335  5.999999999999999e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal  0.204168 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2989  hypothetical protein  34.84 
 
 		 416 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1717  hypothetical protein  33.72 
 
 		 408 aa  133  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4263  hypothetical protein  34.92 
 
 		 404 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2950  hypothetical protein  33.05 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0254  hypothetical protein  33.07 
 
 		 403 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1435  hypothetical protein  30.69 
 
 		 409 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1344  hypothetical protein  33.58 
 
 		 409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.471387  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1169  hypothetical protein  31.81 
 
 		 409 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1548  hypothetical protein  31.81 
 
 		 409 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0990  hypothetical protein  31.54 
 
 		 444 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.64376  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0902  hypothetical protein  31.54 
 
 		 416 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2233  hypothetical protein  31.54 
 
 		 444 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1754  hypothetical protein  31.34 
 
 		 423 aa  126  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0071  hypothetical protein  31.54 
 
 		 444 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0046059  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1019  hypothetical protein  30.03 
 
 		 410 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.871139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1051  hypothetical protein  29.77 
 
 		 410 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0992  hypothetical protein  29.7 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789138  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1100  hypothetical protein  30.69 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3732  hypothetical protein  32.35 
 
 		 466 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.106276  normal  0.539223 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1084  hypothetical protein  30.18 
 
 		 410 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.048603  normal  0.227981 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5418  hypothetical protein  30.87 
 
 		 403 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00920  hypothetical protein  29.47 
 
 		 410 aa  122  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0550337  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2727  protein of unknown function DUF1006  29.47 
 
 		 410 aa  122  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1023  hypothetical protein  29.47 
 
 		 410 aa  122  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0437357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2680  hypothetical protein  29.47 
 
 		 410 aa  122  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.309321  normal  0.302456 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00927  hypothetical protein  29.47 
 
 		 410 aa  122  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2793  hypothetical protein  31.47 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.585867  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4239  hypothetical protein  31.23 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  normal  0.240399 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4762  hypothetical protein  31.11 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3498  hypothetical protein  30.61 
 
 		 403 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281195  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09390  hypothetical protein  32.93 
 
 		 449 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2233  hypothetical protein  33 
 
 		 407 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00963796 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4868  hypothetical protein  30.61 
 
 		 403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1014  hypothetical protein  28.97 
 
 		 410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00266491  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2408  hypothetical protein  28.97 
 
 		 410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173137  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0847  hypothetical protein  30.39 
 
 		 403 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2204  hypothetical protein  28.72 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0443538  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1386  hypothetical protein  31.34 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2745  hypothetical protein  32.66 
 
 		 450 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1077  hypothetical protein  29.15 
 
 		 410 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00717119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1245  protein of unknown function DUF1006  33.93 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2043  hypothetical protein  28.3 
 
 		 387 aa  116  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3033  hypothetical protein  31.39 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3101  hypothetical protein  30.87 
 
 		 394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0111647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4914  hypothetical protein  28.05 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0891  protein of unknown function DUF1006  27.27 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2438  protein of unknown function DUF1006  31.42 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4161  protein of unknown function DUF1006  31.28 
 
 		 410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2506  protein of unknown function DUF1006  32.44 
 
 		 432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0874  hypothetical protein  32.23 
 
 		 494 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2141  hypothetical protein  30.41 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129516  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3291  hypothetical protein  27.25 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.19754  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2707  hypothetical protein  32.26 
 
 		 419 aa  110  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.288749  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1440  hypothetical protein  32.65 
 
 		 405 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179027 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2137  hypothetical protein  36.29 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387118  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1922  protein of unknown function DUF1006  31.13 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.465239 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4037  protein of unknown function DUF1006  35.71 
 
 		 398 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 402 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2230  protein of unknown function DUF1006  33.51 
 
 		 437 aa  106  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00678706  normal  0.39065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3840  hypothetical protein  26.17 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4110  hypothetical protein  29.01 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2311  hypothetical protein  32.97 
 
 		 402 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3917  protein of unknown function DUF1006  28.73 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4332  hypothetical protein  28.74 
 
 		 388 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08640  hypothetical protein  32.43 
 
 		 441 aa  104  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00452751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0372  hypothetical protein  28.57 
 
 		 388 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0367  hypothetical protein  28.57 
 
 		 388 aa  102  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4016  hypothetical protein  29.25 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2383  hypothetical protein  31.73 
 
 		 411 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1487  protein of unknown function DUF1006  29.7 
 
 		 415 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.839829  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3948  protein of unknown function DUF1006  32.07 
 
 		 403 aa  99.8  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751345  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3654  hypothetical protein  28.29 
 
 		 388 aa  99.4  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3994  hypothetical protein  28.05 
 
 		 390 aa  99.4  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1021  hypothetical protein  29.32 
 
 		 442 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3991  hypothetical protein  29.09 
 
 		 406 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0568557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2519  hypothetical protein  27.45 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2209  hypothetical protein  29.11 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.266016  normal  0.263696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5817  protein of unknown function DUF1006  29.93 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0215  protein of unknown function DUF1006  29.9 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0292  hypothetical protein  29.95 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4678  hypothetical protein  31.89 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2326  protein of unknown function DUF1006  37.12 
 
 		 428 aa  94  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.193329  hitchhiker  0.00000627323 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1439  hypothetical protein  32.44 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2101  hypothetical protein  29.7 
 
 		 404 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0625  protein of unknown function DUF1006  27.99 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.045012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6004  protein of unknown function DUF1006  26.26 
 
 		 397 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1587  hypothetical protein  30 
 
 		 402 aa  90.9  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2114  hypothetical protein  29.59 
 
 		 404 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.408029  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2160  hypothetical protein  29.59 
 
 		 404 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25310  hypothetical protein  29.72 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2912  hypothetical protein  29.44 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.260325  normal  0.218883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7587  protein of unknown function DUF1006  28.99 
 
 		 401 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1866  hypothetical protein  22.73 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.908975  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4005  hypothetical protein  30.59 
 
 		 408 aa  87  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0454091 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3809  protein of unknown function DUF1006  33.51 
 
 		 428 aa  87  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0584  protein of unknown function DUF1006  27.3 
 
 		 411 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3685  hypothetical protein  30.79 
 
 		 371 aa  86.7  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319245  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>