120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2209 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2209  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  821    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.266016  normal  0.263696 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1922  protein of unknown function DUF1006  66.32 
 
 		 380 aa  507  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.465239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3840  hypothetical protein  36.7 
 
 		 402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3291  hypothetical protein  33.99 
 
 		 399 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.19754  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3101  hypothetical protein  38.63 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0111647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4914  hypothetical protein  34.01 
 
 		 392 aa  192  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3654  hypothetical protein  35.24 
 
 		 388 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4110  hypothetical protein  36.65 
 
 		 390 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4332  hypothetical protein  35.24 
 
 		 388 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3917  protein of unknown function DUF1006  36.96 
 
 		 390 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0372  hypothetical protein  35.65 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4016  hypothetical protein  37.15 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3994  hypothetical protein  36.89 
 
 		 390 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2519  hypothetical protein  34.77 
 
 		 389 aa  186  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0367  hypothetical protein  35.65 
 
 		 388 aa  186  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6004  protein of unknown function DUF1006  32.08 
 
 		 397 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0584  protein of unknown function DUF1006  31.3 
 
 		 411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0625  protein of unknown function DUF1006  30.71 
 
 		 396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.045012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1010  hypothetical protein  29.74 
 
 		 397 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1587  hypothetical protein  33.52 
 
 		 402 aa  159  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447524 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09390  hypothetical protein  33.15 
 
 		 449 aa  155  9e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1051  hypothetical protein  30.97 
 
 		 410 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1100  hypothetical protein  30.4 
 
 		 410 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0040  hypothetical protein  31.38 
 
 		 404 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0992  hypothetical protein  30.4 
 
 		 410 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789138  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1019  hypothetical protein  30.4 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.871139 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1439  hypothetical protein  32.92 
 
 		 399 aa  150  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1717  hypothetical protein  30.4 
 
 		 408 aa  150  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2793  hypothetical protein  32.68 
 
 		 393 aa  150  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.585867  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4161  protein of unknown function DUF1006  32.97 
 
 		 410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0504  hypothetical protein  29.8 
 
 		 399 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0989166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1084  hypothetical protein  30.11 
 
 		 410 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.048603  normal  0.227981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1418  hypothetical protein  34.12 
 
 		 393 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0272314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2950  hypothetical protein  30.09 
 
 		 401 aa  146  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2043  hypothetical protein  31.55 
 
 		 387 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0254  hypothetical protein  32.55 
 
 		 403 aa  143  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1487  protein of unknown function DUF1006  33.95 
 
 		 415 aa  143  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.839829  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0891  protein of unknown function DUF1006  29.34 
 
 		 388 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0049  hypothetical protein  31.31 
 
 		 406 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1381  hypothetical protein  31.31 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2912  hypothetical protein  30.96 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.260325  normal  0.218883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2178  protein of unknown function DUF1006  33.33 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0894298  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4263  hypothetical protein  31.01 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1754  hypothetical protein  31.64 
 
 		 423 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2230  protein of unknown function DUF1006  32.12 
 
 		 437 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00678706  normal  0.39065 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2989  hypothetical protein  31.35 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3991  hypothetical protein  33.15 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0568557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25310  hypothetical protein  32.4 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7587  protein of unknown function DUF1006  32.39 
 
 		 401 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2233  hypothetical protein  31.39 
 
 		 407 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00963796 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27310  hypothetical protein  31.69 
 
 		 402 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1435  hypothetical protein  29.16 
 
 		 409 aa  136  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4678  hypothetical protein  30.58 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2707  hypothetical protein  31.13 
 
 		 419 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.288749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0874  hypothetical protein  32.86 
 
 		 494 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1169  hypothetical protein  31.32 
 
 		 409 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2233  hypothetical protein  31.15 
 
 		 444 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0071  hypothetical protein  31.15 
 
 		 444 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0046059  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0990  hypothetical protein  31.15 
 
 		 444 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.64376  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1548  hypothetical protein  31.32 
 
 		 409 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0902  hypothetical protein  31.07 
 
 		 416 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4037  protein of unknown function DUF1006  32.45 
 
 		 398 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1021  hypothetical protein  30.22 
 
 		 442 aa  132  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5817  protein of unknown function DUF1006  31.84 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1344  hypothetical protein  31.83 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.471387  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1077  hypothetical protein  28.12 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00717119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3498  hypothetical protein  29.51 
 
 		 403 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4868  hypothetical protein  29.51 
 
 		 403 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5418  hypothetical protein  29.51 
 
 		 403 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1245  protein of unknown function DUF1006  32.22 
 
 		 402 aa  130  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2137  hypothetical protein  32.21 
 
 		 397 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387118  normal  0.200315 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00920  hypothetical protein  27.7 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0550337  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2727  protein of unknown function DUF1006  27.7 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0847  hypothetical protein  28.78 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1386  hypothetical protein  30.6 
 
 		 410 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2311  hypothetical protein  31.68 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1023  hypothetical protein  27.7 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0437357  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1014  hypothetical protein  27.85 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00266491  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2680  hypothetical protein  27.7 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.309321  normal  0.302456 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2408  hypothetical protein  27.85 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173137  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00927  hypothetical protein  27.7 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3809  protein of unknown function DUF1006  31.61 
 
 		 428 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08640  hypothetical protein  29.97 
 
 		 441 aa  127  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00452751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2204  hypothetical protein  27.85 
 
 		 410 aa  127  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0443538  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0292  hypothetical protein  28.99 
 
 		 398 aa  126  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3948  protein of unknown function DUF1006  33.13 
 
 		 403 aa  126  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751345  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0215  protein of unknown function DUF1006  28.39 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4762  hypothetical protein  28.28 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2745  hypothetical protein  32.69 
 
 		 450 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4239  hypothetical protein  28.28 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  normal  0.240399 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2326  protein of unknown function DUF1006  32.75 
 
 		 428 aa  122  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.193329  hitchhiker  0.00000627323 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2438  protein of unknown function DUF1006  29.97 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545922 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3732  hypothetical protein  28.57 
 
 		 466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.106276  normal  0.539223 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3685  hypothetical protein  30.08 
 
 		 371 aa  121  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1440  hypothetical protein  28.93 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179027 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2101  hypothetical protein  28.49 
 
 		 404 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2506  protein of unknown function DUF1006  30.31 
 
 		 432 aa  119  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2114  hypothetical protein  28.33 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.408029  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2160  hypothetical protein  28.33 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2789  hypothetical protein  28.49 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>