119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4021 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4021  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  730    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1855  protein of unknown function DUF1006  61.84 
 
 		 365 aa  418  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2290  hypothetical protein  61.56 
 
 		 365 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000676004 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2127  hypothetical protein  59.94 
 
 		 370 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0125  hypothetical protein  62.84 
 
 		 360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0129878 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1661  hypothetical protein  45.97 
 
 		 382 aa  263  3e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.874726  normal  0.124074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2950  hypothetical protein  27.76 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1245  protein of unknown function DUF1006  30.3 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1866  hypothetical protein  24.52 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.908975  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1077  hypothetical protein  27.51 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00717119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1014  hypothetical protein  27.18 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00266491  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1051  hypothetical protein  26.03 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.241147 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00920  hypothetical protein  26.45 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0550337  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2727  protein of unknown function DUF1006  26.45 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3994  hypothetical protein  26.5 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1023  hypothetical protein  26.45 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0437357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2680  hypothetical protein  26.45 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.309321  normal  0.302456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3685  hypothetical protein  28.08 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0891  protein of unknown function DUF1006  25.56 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1922  protein of unknown function DUF1006  25.42 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.465239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3917  protein of unknown function DUF1006  27.13 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00927  hypothetical protein  26.45 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2204  hypothetical protein  28.62 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0443538  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1019  hypothetical protein  25.95 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.871139 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4016  hypothetical protein  26.54 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2408  hypothetical protein  26.86 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173137  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0215  protein of unknown function DUF1006  28.03 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1169  hypothetical protein  28.69 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0254  hypothetical protein  27.96 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2233  hypothetical protein  29.66 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0367  hypothetical protein  26.71 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0071  hypothetical protein  29.66 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0046059  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0990  hypothetical protein  29.66 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.64376  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0902  hypothetical protein  28.69 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1548  hypothetical protein  28.69 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1084  hypothetical protein  25.65 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.048603  normal  0.227981 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1100  hypothetical protein  25.79 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4332  hypothetical protein  26.75 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1754  hypothetical protein  28.62 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2519  hypothetical protein  24.27 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0992  hypothetical protein  25.39 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789138  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1487  protein of unknown function DUF1006  29.28 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.839829  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0372  hypothetical protein  26.2 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4110  hypothetical protein  26.81 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3654  hypothetical protein  25.88 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3033  hypothetical protein  30.63 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4914  hypothetical protein  27.03 
 
 		 392 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09390  hypothetical protein  28.36 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1435  hypothetical protein  24.68 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3101  hypothetical protein  25.74 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0111647 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1386  hypothetical protein  29.72 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1717  hypothetical protein  26.52 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3506  protein of unknown function DUF1006  26.6 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal  0.204168 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4263  hypothetical protein  28.35 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2326  protein of unknown function DUF1006  28.7 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.193329  hitchhiker  0.00000627323 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2793  hypothetical protein  29.62 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.585867  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1439  hypothetical protein  25.99 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4161  protein of unknown function DUF1006  26.55 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0625  protein of unknown function DUF1006  25.47 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.045012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0847  hypothetical protein  27.13 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25310  hypothetical protein  26.38 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2438  protein of unknown function DUF1006  28.62 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27310  hypothetical protein  27.79 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4239  hypothetical protein  26.5 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  normal  0.240399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3809  protein of unknown function DUF1006  27.86 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1344  hypothetical protein  30.03 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.471387  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4762  hypothetical protein  40.43 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2506  protein of unknown function DUF1006  27.85 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2834  hypothetical protein  28.14 
 
 		 410 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2141  hypothetical protein  55.36 
 
 		 406 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129516  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0584  protein of unknown function DUF1006  25.44 
 
 		 411 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3840  hypothetical protein  26.03 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3948  protein of unknown function DUF1006  29.46 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751345  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08640  hypothetical protein  41 
 
 		 441 aa  66.6  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00452751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2989  hypothetical protein  27.83 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3498  hypothetical protein  39.36 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4868  hypothetical protein  39.36 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0292  hypothetical protein  26.42 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2230  protein of unknown function DUF1006  60.78 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00678706  normal  0.39065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7587  protein of unknown function DUF1006  42.35 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1440  hypothetical protein  41.18 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179027 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1021  hypothetical protein  38.94 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2707  hypothetical protein  27.64 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.288749  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3732  hypothetical protein  28.79 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.106276  normal  0.539223 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1010  hypothetical protein  36.11 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0040  hypothetical protein  27.62 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2209  hypothetical protein  24.41 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.266016  normal  0.263696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0874  hypothetical protein  40.2 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1587  hypothetical protein  37.38 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447524 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5418  hypothetical protein  51.79 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3991  hypothetical protein  25.95 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0568557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2334  hypothetical protein  28.82 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4678  hypothetical protein  27.2 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4037  protein of unknown function DUF1006  27.92 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2137  hypothetical protein  47.54 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387118  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0997  hypothetical protein  28.18 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.728779  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2912  hypothetical protein  42.86 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.260325  normal  0.218883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1418  hypothetical protein  28.35 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0272314 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2155  hypothetical protein  23.22 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1381  hypothetical protein  49.12 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>