38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1445 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1445  ompT protein  100 
 
 		 368 aa  741    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000193384  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003962  outer membrane protein OmpT  45.05 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  25.13 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  25.13 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  27.48 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  25.95 
 
 		 397 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  26.72 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  27.48 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2057  porin  32.52 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  27.1 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3127  porin Gram-negative type  21.93 
 
 		 333 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3847  porin  24.51 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  24.61 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1474  porin  26.98 
 
 		 311 aa  46.2  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  24.07 
 
 		 338 aa  46.2  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1750  outer membrane porin protein LC  29.27 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.778273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1687  outer membrane porin protein LC  29.27 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.535168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1689  outer membrane porin protein LC  29.27 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0295  outer membrane phosphoporin protein E  31.16 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372368 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1770  outer membrane porin protein LC  29.27 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2493  outer membrane porin protein C  30.58 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2403  outer membrane porin protein C  30.58 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00624536  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2610  outer membrane porin protein C  30.58 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.440954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  26.48 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0286  outer membrane phosphoporin protein E  31.16 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172379  normal  0.530203 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2507  outer membrane porin protein C  30.58 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00241  hypothetical protein  31.16 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.693331  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2451  outer membrane porin protein C  30.58 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487875 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0238  outer membrane phosphoporin protein E  32.76 
 
 		 351 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00238  outer membrane phosphoporin protein E  31.16 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.86907  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3340  outer membrane phosphoporin protein E  31.16 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0273  outer membrane phosphoporin protein E  31.16 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.664027  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0971  ompH family outer membrane protein  26.95 
 
 		 316 aa  45.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000094699  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  23.68 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  27.55 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1641  outer membrane protein N  28.06 
 
 		 383 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  0.976453 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  26.78 
 
 		 316 aa  43.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2839  porin  29.91 
 
 		 360 aa  42.7  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>