More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0263 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 
882 aa  668    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0263  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 
874 aa  1784    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  42 
 
 
876 aa  740    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
883 aa  638    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
881 aa  748    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
883 aa  714    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
881 aa  748    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
881 aa  748    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl355  valyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
873 aa  766    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.473625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
881 aa  746    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
874 aa  651    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
880 aa  752    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0504  valyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
884 aa  728    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000238585  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 
879 aa  677    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
881 aa  650    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
881 aa  748    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0258  valyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 
872 aa  798    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
881 aa  745    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
884 aa  637    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 
876 aa  743    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
881 aa  748    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
892 aa  650    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
881 aa  687    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
881 aa  744    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
881 aa  755    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
880 aa  758    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
881 aa  746    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
881 aa  747    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 
880 aa  635    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 
879 aa  654    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2479  valyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
880 aa  707    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225877  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1392  valyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
902 aa  719    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0390871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1219  valyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 
879 aa  723    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
894 aa  696    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 
883 aa  726    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 
876 aa  743    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
892 aa  636    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 
881 aa  644    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 
885 aa  632  1e-180  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 
881 aa  634  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 
880 aa  630  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 
880 aa  631  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 
883 aa  630  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
879 aa  625  1e-178  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 
882 aa  620  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 
909 aa  619  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
874 aa  619  1e-176  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0010  valyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 
922 aa  622  1e-176  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.885408  hitchhiker  0.00234532 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 
865 aa  617  1e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
909 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0367  valyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 
907 aa  614  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.159173  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2538  valyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 
897 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
886 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 
909 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0129  valyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 
904 aa  611  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525564  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
909 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11620  valyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 
944 aa  605  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1165  valyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
877 aa  608  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 
884 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2685  valyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 
888 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000391784 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
887 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1535  valyl-tRNA synthetase  35.72 
 
 
883 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0308753  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1629  valyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
883 aa  608  9.999999999999999e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 
893 aa  607  9.999999999999999e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1531  valyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 
888 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1799  valyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
886 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.398016  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
865 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 
885 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3872  valyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 
872 aa  599  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0684  valyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 
917 aa  600  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.980667  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3530  valyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 
943 aa  600  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723438  normal  0.0830498 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0291  valyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
890 aa  598  1e-169  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 
880 aa  595  1e-169  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2572  valyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 
884 aa  598  1e-169  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00293466  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
866 aa  598  1e-169  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
883 aa  594  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0986  valyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
948 aa  593  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1503  valyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 
924 aa  595  1e-168  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000330515  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3493  valyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 
872 aa  594  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0555  valyl-tRNA synthetase  34.06 
 
 
917 aa  593  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2053  valyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 
884 aa  589  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0948742  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 
891 aa  592  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0251  valyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
886 aa  590  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 
880 aa  585  1e-166  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2045  valyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 
887 aa  587  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1279  valyl-tRNA synthetase  34.06 
 
 
950 aa  588  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1086  valyl-tRNA synthetase  34.83 
 
 
948 aa  588  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1091  valyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 
929 aa  585  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
1006 aa  586  1e-166  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0091  valyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 
943 aa  586  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 
911 aa  587  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14440  valyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 
950 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0722  valyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 
895 aa  587  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3951  valyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 
897 aa  586  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594097  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4240  valyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 
948 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_372  valyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 
880 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0207996  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 
1002 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1688  valyl-tRNA synthetase  35.3 
 
 
902 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.524019 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3006  valyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 
909 aa  582  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2765  valyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 
883 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.700056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>