More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0113 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0113  nucleotidyl transferase  100 
 
 
254 aa  511  1e-144  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00523302  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  34.33 
 
 
818 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  31.9 
 
 
238 aa  119  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  34.33 
 
 
810 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  34.47 
 
 
833 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1231  flagellin modification protein PtmE, putative sugar-phosphate nucleotide transferase  29.61 
 
 
345 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000208573  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.06 
 
 
355 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  31.1 
 
 
840 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1456  nucleotidyl transferase  32.81 
 
 
361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  32.63 
 
 
816 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  32.77 
 
 
832 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  30.21 
 
 
843 aa  113  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  30.38 
 
 
351 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.65 
 
 
355 aa  113  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  34.03 
 
 
830 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  33.9 
 
 
834 aa  112  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  31.15 
 
 
238 aa  112  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  30.83 
 
 
841 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31.49 
 
 
842 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  34.2 
 
 
349 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  30.47 
 
 
827 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  31.78 
 
 
843 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  34.18 
 
 
820 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  32.77 
 
 
827 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  31.91 
 
 
828 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  32.9 
 
 
476 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  29.8 
 
 
842 aa  109  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  32.65 
 
 
841 aa  109  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
833 aa  108  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.47 
 
 
828 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  31.49 
 
 
835 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  30.34 
 
 
348 aa  107  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  28.69 
 
 
828 aa  107  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  32.49 
 
 
776 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  29.79 
 
 
784 aa  106  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.63 
 
 
842 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  30.96 
 
 
837 aa  105  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  32.68 
 
 
348 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  30.64 
 
 
784 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  30.8 
 
 
784 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  30.8 
 
 
784 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30.8 
 
 
784 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30.8 
 
 
784 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  30.47 
 
 
828 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  30.8 
 
 
784 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  32.02 
 
 
405 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  32.47 
 
 
365 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  31.65 
 
 
820 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  30.64 
 
 
784 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  30.8 
 
 
784 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  30.8 
 
 
784 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  30.21 
 
 
712 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.33 
 
 
357 aa  102  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  31.58 
 
 
392 aa  102  6e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  29.51 
 
 
389 aa  102  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  31.38 
 
 
361 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  28.74 
 
 
842 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  31.62 
 
 
830 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1518  nucleotidyltransferase family protein  29.74 
 
 
341 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.973367  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  31.36 
 
 
854 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0633  Nucleotidyl transferase  30.77 
 
 
353 aa  99.4  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  30.43 
 
 
347 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  27.78 
 
 
238 aa  99  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0258  nucleotidyl transferase  33.47 
 
 
425 aa  99  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.402702  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  32.77 
 
 
832 aa  99  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  28.51 
 
 
399 aa  98.6  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  29.83 
 
 
785 aa  97.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  31.93 
 
 
832 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0365  Nucleotidyl transferase  30.08 
 
 
355 aa  97.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  30.96 
 
 
361 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  32.23 
 
 
388 aa  97.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.48 
 
 
357 aa  96.7  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  32.75 
 
 
351 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  30.8 
 
 
361 aa  96.3  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  27.54 
 
 
392 aa  96.3  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  31.42 
 
 
387 aa  96.3  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  29.2 
 
 
387 aa  96.3  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  28.33 
 
 
835 aa  96.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  29.1 
 
 
381 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2301  nucleotidyl transferase  28.82 
 
 
348 aa  95.9  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.86 
 
 
393 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0380  nucleotidyltransferase family protein  28.88 
 
 
341 aa  95.9  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0529  Nucleotidyl transferase  30.57 
 
 
352 aa  95.5  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0885  Nucleotidyl transferase  27.51 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.51 
 
 
359 aa  94.4  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01171  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29.06 
 
 
320 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  27.12 
 
 
836 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  29.1 
 
 
392 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  33.19 
 
 
359 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  30.34 
 
 
357 aa  94  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  30.3 
 
 
366 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  28.34 
 
 
388 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  29.1 
 
 
392 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.12 
 
 
344 aa  93.2  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.54 
 
 
836 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  26.69 
 
 
836 aa  93.6  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  30.8 
 
 
346 aa  93.6  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  29.91 
 
 
357 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  28.82 
 
 
387 aa  93.2  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.17 
 
 
376 aa  93.2  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>