39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0137 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0137  Abortive infection protein  100 
 
 		 259 aa  501  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  51.55 
 
 		 264 aa  231  6e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  50 
 
 		 257 aa  225  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  50.97 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  49.41 
 
 		 256 aa  215  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  53.04 
 
 		 268 aa  211  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  50.39 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  50.39 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  46.88 
 
 		 259 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  45.7 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  46.48 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  46.48 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  45.45 
 
 		 241 aa  181  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3452  Abortive infection protein  45.85 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  46.18 
 
 		 256 aa  171  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  43.09 
 
 		 277 aa  171  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  44.18 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  44.71 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  45.68 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  38.93 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  41.8 
 
 		 269 aa  156  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  44.03 
 
 		 258 aa  155  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  39.92 
 
 		 269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  43.44 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3260  Abortive infection protein  40.36 
 
 		 293 aa  143  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  38.91 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  41.43 
 
 		 273 aa  138  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  41.37 
 
 		 286 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04670  CAAX amino terminal protease family  57.45 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.767704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4030  Abortive infection protein  44.55 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  41 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.750213 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1376  hypothetical protein  40.16 
 
 		 437 aa  112  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  36.15 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06020  hypothetical protein  34.59 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.334826  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  33.68 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  28.57 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2361  abortive infection protein  26.01 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1923  abortive infection protein  32.91 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4016  hypothetical protein  31.37 
 
 		 360 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.905588  normal  0.0158572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>