38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4773 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  100 
 
 
269 aa  535  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  51.02 
 
 
267 aa  230  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  53.45 
 
 
256 aa  230  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  51.91 
 
 
256 aa  222  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  52.52 
 
 
273 aa  219  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  49.79 
 
 
258 aa  214  9e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3452  Abortive infection protein  48.37 
 
 
282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  51.28 
 
 
269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  47.06 
 
 
260 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  49.38 
 
 
263 aa  207  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  45.6 
 
 
255 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1376  hypothetical protein  48.88 
 
 
437 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  52.08 
 
 
296 aa  202  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  50.21 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3260  Abortive infection protein  44.14 
 
 
293 aa  192  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  47.22 
 
 
253 aa  190  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  44.54 
 
 
277 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  50.42 
 
 
272 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.750213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  42.32 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  43.42 
 
 
241 aa  162  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  41.49 
 
 
257 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  43.51 
 
 
255 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  39.84 
 
 
264 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06020  hypothetical protein  38.7 
 
 
295 aa  157  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.334826  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  42.15 
 
 
256 aa  156  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4030  Abortive infection protein  42.79 
 
 
242 aa  155  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  41.77 
 
 
259 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0137  Abortive infection protein  41.9 
 
 
259 aa  151  8e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  41.37 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  41.37 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  41.08 
 
 
268 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  41.08 
 
 
268 aa  143  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  42.31 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04670  CAAX amino terminal protease family  49.35 
 
 
302 aa  110  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.767704  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  34.52 
 
 
242 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0605  caax amino protease family protein  25 
 
 
237 aa  51.2  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.364095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4016  hypothetical protein  32.14 
 
 
360 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.905588  normal  0.0158572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  31.96 
 
 
251 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>