41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04670 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_04670  CAAX amino terminal protease family  100 
 
 		 302 aa  567  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.767704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  45.72 
 
 		 256 aa  215  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  44.08 
 
 		 256 aa  203  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  41.58 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  41.39 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  38.7 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3260  Abortive infection protein  40.92 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3452  Abortive infection protein  40.61 
 
 		 282 aa  175  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  38.41 
 
 		 267 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  56.33 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  40.8 
 
 		 269 aa  169  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  37.97 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  38.44 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  55.7 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  55.7 
 
 		 257 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  55.7 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  55.7 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  38.67 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1376  hypothetical protein  41.25 
 
 		 437 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  51.19 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  54.97 
 
 		 253 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  51.9 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  53.12 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  56.33 
 
 		 268 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  56.33 
 
 		 268 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  55.06 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  55.06 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  54.14 
 
 		 268 aa  139  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4030  Abortive infection protein  38.52 
 
 		 242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06020  hypothetical protein  34.58 
 
 		 295 aa  134  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.334826  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  47.47 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0137  Abortive infection protein  57.45 
 
 		 259 aa  126  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  51.85 
 
 		 272 aa  122  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.750213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  49.35 
 
 		 269 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  34.44 
 
 		 251 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  28.12 
 
 		 242 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4016  hypothetical protein  35.16 
 
 		 360 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.905588  normal  0.0158572 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1183  permease  29.1 
 
 		 232 aa  46.6  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  29.03 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0291  Abortive infection protein  33.72 
 
 		 567 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.621613  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22110  hypothetical protein  34.78 
 
 		 237 aa  42.7  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>