36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4030 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4030  Abortive infection protein  100 
 
 
242 aa  462  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3452  Abortive infection protein  65.15 
 
 
282 aa  293  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  61.98 
 
 
269 aa  278  8e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  58.02 
 
 
263 aa  262  4e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  52.97 
 
 
256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  51.27 
 
 
256 aa  224  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3260  Abortive infection protein  50 
 
 
293 aa  223  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  50.2 
 
 
260 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  50.42 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  48.31 
 
 
253 aa  192  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  48.91 
 
 
273 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  45.18 
 
 
277 aa  171  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06020  hypothetical protein  45.45 
 
 
295 aa  171  9e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.334826  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  48.28 
 
 
258 aa  169  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  45.69 
 
 
267 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  45.02 
 
 
256 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  45.89 
 
 
255 aa  156  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  44.96 
 
 
264 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1376  hypothetical protein  48.03 
 
 
437 aa  155  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  49.78 
 
 
286 aa  155  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  43.35 
 
 
264 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  44.44 
 
 
257 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  42.79 
 
 
269 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  46.38 
 
 
259 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  44.23 
 
 
241 aa  141  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  44.1 
 
 
296 aa  137  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  42.92 
 
 
268 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  42.92 
 
 
268 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  43.11 
 
 
268 aa  129  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  50.66 
 
 
272 aa  128  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.750213 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  45.89 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  45.89 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04670  CAAX amino terminal protease family  38.18 
 
 
302 aa  118  9e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.767704  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0137  Abortive infection protein  46.23 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  33.7 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22110  hypothetical protein  38.3 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>