37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1376 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1376  hypothetical protein  100 
 
 
437 aa  845    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  70.85 
 
 
273 aa  333  4e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  55.56 
 
 
267 aa  247  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  54.03 
 
 
258 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  55.46 
 
 
256 aa  222  9e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  53.59 
 
 
256 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3452  Abortive infection protein  50.97 
 
 
282 aa  211  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  52.61 
 
 
286 aa  209  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  48.78 
 
 
263 aa  208  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  49.79 
 
 
269 aa  206  8e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  49.81 
 
 
269 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  46.99 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  50.41 
 
 
255 aa  199  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  46.37 
 
 
296 aa  195  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  47.22 
 
 
277 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3260  Abortive infection protein  46.88 
 
 
293 aa  192  8e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  51.67 
 
 
253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  52.21 
 
 
272 aa  176  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.750213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  42.34 
 
 
264 aa  163  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  44.21 
 
 
241 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4030  Abortive infection protein  48.03 
 
 
242 aa  159  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06020  hypothetical protein  44.79 
 
 
295 aa  155  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.334826  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  43.09 
 
 
256 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  41.25 
 
 
255 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  39.69 
 
 
257 aa  142  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  41.06 
 
 
259 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  39.69 
 
 
264 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04670  CAAX amino terminal protease family  56.52 
 
 
302 aa  137  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.767704  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  40.65 
 
 
259 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  40.65 
 
 
259 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  40.54 
 
 
268 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  40.54 
 
 
268 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  41.46 
 
 
268 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0137  Abortive infection protein  40.16 
 
 
259 aa  113  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  31.52 
 
 
251 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  29 
 
 
279 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0605  caax amino protease family protein  28.75 
 
 
237 aa  44.7  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.364095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>