37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4542 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  100 
 
 
256 aa  495  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  92.58 
 
 
256 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3452  Abortive infection protein  61.48 
 
 
282 aa  290  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  54.86 
 
 
269 aa  260  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  52.26 
 
 
263 aa  251  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  51.19 
 
 
260 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  53.85 
 
 
255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3260  Abortive infection protein  52.71 
 
 
293 aa  241  6e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  52.02 
 
 
267 aa  226  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  53.2 
 
 
273 aa  225  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  54.13 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  51.64 
 
 
286 aa  219  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  51.65 
 
 
258 aa  218  6e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4030  Abortive infection protein  52.97 
 
 
242 aa  218  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  47.52 
 
 
277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  53.45 
 
 
269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06020  hypothetical protein  49.81 
 
 
295 aa  211  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.334826  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1376  hypothetical protein  53.59 
 
 
437 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  50.83 
 
 
296 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  46.18 
 
 
264 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  47.28 
 
 
256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  45.83 
 
 
241 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  50.83 
 
 
272 aa  178  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.750213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  45.6 
 
 
255 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  45.71 
 
 
259 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  42.91 
 
 
264 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04670  CAAX amino terminal protease family  45.72 
 
 
302 aa  169  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.767704  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  42.51 
 
 
257 aa  169  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  44.53 
 
 
268 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  44.53 
 
 
268 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0137  Abortive infection protein  46.18 
 
 
259 aa  156  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  45.31 
 
 
259 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  45.31 
 
 
259 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  47.22 
 
 
268 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  42.27 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  25.47 
 
 
242 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4016  hypothetical protein  32.22 
 
 
360 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.905588  normal  0.0158572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>