36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4840 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4840  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 
272 aa  517  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0130  hypothetical protein  61.11 
 
 
270 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174648  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5330  hypothetical protein  61.76 
 
 
262 aa  299  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174175 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0212  filamentation induced by cAMP protein Fic  63.1 
 
 
258 aa  297  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.773085  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0478  hypothetical protein  59.93 
 
 
257 aa  285  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0588  hypothetical protein  54.79 
 
 
262 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.622459  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4295  hypothetical protein  48.18 
 
 
343 aa  206  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.402555  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0320  hypothetical protein  50 
 
 
329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.249889  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4433  hypothetical protein  44.03 
 
 
249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0872  hypothetical protein  46.44 
 
 
247 aa  178  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4042  hypothetical protein  43.7 
 
 
249 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0264  hypothetical protein  46.27 
 
 
240 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0073  hypothetical protein  42.41 
 
 
260 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3911  hypothetical protein  44.53 
 
 
245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13692  hypothetical protein  44.36 
 
 
256 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.31316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0514  hypothetical protein  41.03 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5195  hypothetical protein  42.07 
 
 
246 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000065198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5424  hypothetical protein  43.49 
 
 
263 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1381  hypothetical protein  40.74 
 
 
248 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  0.081162 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25360  hypothetical protein  41.98 
 
 
288 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36000  hypothetical protein  39.41 
 
 
248 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14694  normal  0.163356 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4808  hypothetical protein  42.38 
 
 
246 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.449247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4894  hypothetical protein  42.38 
 
 
246 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.270155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0727  heat repeat-containing PBS lyase  48.29 
 
 
254 aa  131  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2801  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.48 
 
 
300 aa  64.3  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3761  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.67 
 
 
430 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.26 
 
 
412 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  31.19 
 
 
429 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.86 
 
 
412 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.99 
 
 
380 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.37 
 
 
408 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  21.38 
 
 
359 aa  45.4  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.75 
 
 
400 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.18 
 
 
384 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2152  filamentation induced by cAMP protein Fic  21.98 
 
 
374 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164511  normal  0.297035 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.61 
 
 
358 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>