24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0073 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0073  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  502  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0212  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.67 
 
 
258 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.773085  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0478  hypothetical protein  45.52 
 
 
257 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0130  hypothetical protein  44.65 
 
 
270 aa  175  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174648  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5330  hypothetical protein  44.12 
 
 
262 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174175 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4840  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.6 
 
 
272 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0588  hypothetical protein  44.31 
 
 
262 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.622459  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4433  hypothetical protein  38.91 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4042  hypothetical protein  38.02 
 
 
249 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4295  hypothetical protein  37.2 
 
 
343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.402555  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0872  hypothetical protein  41.96 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0320  hypothetical protein  39.55 
 
 
329 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.249889  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13692  hypothetical protein  38.78 
 
 
256 aa  122  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.31316 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3911  hypothetical protein  39.39 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5195  hypothetical protein  39.22 
 
 
246 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000065198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1381  hypothetical protein  40.61 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  0.081162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0264  hypothetical protein  36.9 
 
 
240 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0514  hypothetical protein  36.58 
 
 
251 aa  106  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5424  hypothetical protein  41.02 
 
 
263 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25360  hypothetical protein  38.83 
 
 
288 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4894  hypothetical protein  39.37 
 
 
246 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.270155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4808  hypothetical protein  39.37 
 
 
246 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.449247  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36000  hypothetical protein  36.05 
 
 
248 aa  102  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14694  normal  0.163356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0727  heat repeat-containing PBS lyase  39.16 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>