27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36000 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_36000  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  478  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14694  normal  0.163356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0264  hypothetical protein  63.9 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0514  hypothetical protein  57.96 
 
 		 251 aa  248  7e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5195  hypothetical protein  57.32 
 
 		 246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000065198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3911  hypothetical protein  55.28 
 
 		 245 aa  228  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4808  hypothetical protein  58.13 
 
 		 246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.449247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4894  hypothetical protein  58.13 
 
 		 246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.270155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1381  hypothetical protein  58.85 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  0.081162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13692  hypothetical protein  58 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.31316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5424  hypothetical protein  57.79 
 
 		 263 aa  204  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0478  hypothetical protein  46.88 
 
 		 257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0212  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.19 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.773085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4042  hypothetical protein  47.08 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4433  hypothetical protein  46.67 
 
 		 249 aa  168  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0588  hypothetical protein  52.56 
 
 		 262 aa  164  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.622459  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0130  hypothetical protein  40.68 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174648  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5330  hypothetical protein  42.15 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0872  hypothetical protein  45.38 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4840  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.65 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0727  heat repeat-containing PBS lyase  54.14 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0320  hypothetical protein  34.13 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.249889  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4295  hypothetical protein  34.04 
 
 		 343 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.402555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0073  hypothetical protein  39.33 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25360  hypothetical protein  34.69 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2801  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.9 
 
 		 300 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  28 
 
 		 367 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4789  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.42 
 
 		 282 aa  42  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>