30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0478 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0478  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0212  filamentation induced by cAMP protein Fic  72.48 
 
 		 258 aa  348  3e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.773085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5330  hypothetical protein  59.54 
 
 		 262 aa  262  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174175 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4840  filamentation induced by cAMP protein Fic  59.93 
 
 		 272 aa  259  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0130  hypothetical protein  53.85 
 
 		 270 aa  245  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174648  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0588  hypothetical protein  53.6 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.622459  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0264  hypothetical protein  46.64 
 
 		 240 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0872  hypothetical protein  47.27 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4295  hypothetical protein  43.2 
 
 		 343 aa  170  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.402555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4042  hypothetical protein  46.09 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4433  hypothetical protein  45.88 
 
 		 249 aa  166  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0073  hypothetical protein  43.82 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5195  hypothetical protein  45.91 
 
 		 246 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000065198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0320  hypothetical protein  42.77 
 
 		 329 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.249889  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36000  hypothetical protein  46.48 
 
 		 248 aa  155  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14694  normal  0.163356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3911  hypothetical protein  45.59 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4808  hypothetical protein  45.91 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.449247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4894  hypothetical protein  45.91 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.270155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0514  hypothetical protein  39.77 
 
 		 251 aa  145  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1381  hypothetical protein  41.25 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  0.081162 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25360  hypothetical protein  40.29 
 
 		 288 aa  139  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13692  hypothetical protein  42.91 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.31316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5424  hypothetical protein  42.8 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0727  heat repeat-containing PBS lyase  50.88 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2801  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.55 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3761  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.61 
 
 		 430 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.09 
 
 		 412 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.41 
 
 		 412 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.67 
 
 		 408 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  32.98 
 
 		 406 aa  42.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>