29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0320 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0320  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  623  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.249889  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4295  hypothetical protein  57.83 
 
 
343 aa  277  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.402555  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4840  filamentation induced by cAMP protein Fic  50 
 
 
272 aa  225  8e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0130  hypothetical protein  44.75 
 
 
270 aa  217  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0478  hypothetical protein  43.71 
 
 
257 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0212  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.16 
 
 
258 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.773085  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5330  hypothetical protein  42.14 
 
 
262 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0588  hypothetical protein  40.72 
 
 
262 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.622459  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4433  hypothetical protein  36.51 
 
 
249 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4042  hypothetical protein  35.95 
 
 
249 aa  153  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0872  hypothetical protein  36.1 
 
 
247 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0073  hypothetical protein  38.17 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25360  hypothetical protein  36.79 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0264  hypothetical protein  35.67 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5195  hypothetical protein  34.6 
 
 
246 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000065198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3911  hypothetical protein  36.25 
 
 
245 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0514  hypothetical protein  34.17 
 
 
251 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13692  hypothetical protein  35.29 
 
 
256 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.31316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1381  hypothetical protein  32.29 
 
 
248 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  0.081162 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36000  hypothetical protein  33.02 
 
 
248 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14694  normal  0.163356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5424  hypothetical protein  33.13 
 
 
263 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4808  hypothetical protein  33.65 
 
 
246 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.449247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4894  hypothetical protein  33.65 
 
 
246 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.270155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0727  heat repeat-containing PBS lyase  29.11 
 
 
254 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2801  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.51 
 
 
300 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  28.71 
 
 
348 aa  46.6  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  28.71 
 
 
348 aa  46.6  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0346  Fic family protein  22.69 
 
 
360 aa  43.9  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.14 
 
 
400 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>