45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5330 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5330  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  504  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174175 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0130  hypothetical protein  67.69 
 
 		 270 aa  343  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174648  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4840  filamentation induced by cAMP protein Fic  61.76 
 
 		 272 aa  290  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0478  hypothetical protein  59.54 
 
 		 257 aa  268  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0212  filamentation induced by cAMP protein Fic  58.62 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.773085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0588  hypothetical protein  52.99 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.622459  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4433  hypothetical protein  44.71 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4042  hypothetical protein  43.2 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0872  hypothetical protein  46.69 
 
 		 247 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4295  hypothetical protein  42.6 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.402555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0264  hypothetical protein  44.57 
 
 		 240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25360  hypothetical protein  42.49 
 
 		 288 aa  157  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0320  hypothetical protein  41.82 
 
 		 329 aa  155  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.249889  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0073  hypothetical protein  44.12 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5195  hypothetical protein  40.47 
 
 		 246 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000065198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3911  hypothetical protein  42.26 
 
 		 245 aa  139  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4808  hypothetical protein  40.86 
 
 		 246 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.449247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4894  hypothetical protein  40.86 
 
 		 246 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.270155 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13692  hypothetical protein  40.89 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.31316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36000  hypothetical protein  40.15 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14694  normal  0.163356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1381  hypothetical protein  39.84 
 
 		 248 aa  131  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  0.081162 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0514  hypothetical protein  37.83 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5424  hypothetical protein  40.15 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0727  heat repeat-containing PBS lyase  42.92 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2801  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.89 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.9 
 
 		 412 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  34.86 
 
 		 429 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3761  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.69 
 
 		 430 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5504  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.65 
 
 		 394 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0732622  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  20.87 
 
 		 380 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.17 
 
 		 412 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.33 
 
 		 384 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3978  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 422 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.09 
 
 		 380 aa  45.8  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  34.04 
 
 		 406 aa  45.4  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0346  Fic family protein  19.86 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.61 
 
 		 392 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.36 
 
 		 364 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0777  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.27 
 
 		 356 aa  43.5  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4104  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.88 
 
 		 408 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33230  hypothetical protein  34.21 
 
 		 408 aa  43.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2627  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.69 
 
 		 384 aa  43.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2528  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.61 
 
 		 357 aa  43.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0373  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.45 
 
 		 371 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.5223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.77 
 
 		 400 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>