28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4433 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4433  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  474  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4042  hypothetical protein  93.17 
 
 
249 aa  441  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0872  hypothetical protein  61.09 
 
 
247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0212  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.49 
 
 
258 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.773085  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0130  hypothetical protein  43.31 
 
 
270 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174648  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5330  hypothetical protein  44.71 
 
 
262 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0478  hypothetical protein  45.88 
 
 
257 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4840  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.97 
 
 
272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0264  hypothetical protein  47.7 
 
 
240 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5195  hypothetical protein  45.11 
 
 
246 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000065198 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0514  hypothetical protein  43.95 
 
 
251 aa  145  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36000  hypothetical protein  46.25 
 
 
248 aa  143  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14694  normal  0.163356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1381  hypothetical protein  45.68 
 
 
248 aa  141  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  0.081162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5424  hypothetical protein  47.52 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0588  hypothetical protein  45.49 
 
 
262 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.622459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4894  hypothetical protein  45.96 
 
 
246 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.270155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4808  hypothetical protein  45.96 
 
 
246 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.449247  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3911  hypothetical protein  45.23 
 
 
245 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13692  hypothetical protein  43.48 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.31316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4295  hypothetical protein  42.46 
 
 
343 aa  123  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.402555  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0320  hypothetical protein  37.14 
 
 
329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.249889  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0073  hypothetical protein  40.65 
 
 
260 aa  111  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25360  hypothetical protein  37 
 
 
288 aa  106  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0727  heat repeat-containing PBS lyase  44.51 
 
 
254 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  34.31 
 
 
394 aa  53.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  30 
 
 
412 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3761  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 
430 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.85 
 
 
412 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>