25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0264 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0264  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  462  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36000  hypothetical protein  63.49 
 
 		 248 aa  255  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14694  normal  0.163356 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0514  hypothetical protein  59.35 
 
 		 251 aa  244  8e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5195  hypothetical protein  56.5 
 
 		 246 aa  238  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000065198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4808  hypothetical protein  57.32 
 
 		 246 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.449247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4894  hypothetical protein  57.32 
 
 		 246 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.270155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1381  hypothetical protein  56.2 
 
 		 248 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  0.081162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5424  hypothetical protein  60.25 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3911  hypothetical protein  54.07 
 
 		 245 aa  218  6e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13692  hypothetical protein  56.4 
 
 		 256 aa  206  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.31316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0478  hypothetical protein  46.64 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0212  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.14 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.773085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4042  hypothetical protein  48.54 
 
 		 249 aa  171  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5330  hypothetical protein  44.57 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174175 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4433  hypothetical protein  47.7 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0130  hypothetical protein  42.02 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174648  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4840  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.27 
 
 		 272 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0588  hypothetical protein  49.34 
 
 		 262 aa  158  9e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.622459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0872  hypothetical protein  47.72 
 
 		 247 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0727  heat repeat-containing PBS lyase  50.52 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4295  hypothetical protein  41.83 
 
 		 343 aa  102  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.402555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0320  hypothetical protein  34.7 
 
 		 329 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.249889  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0073  hypothetical protein  38.98 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25360  hypothetical protein  34.69 
 
 		 288 aa  82  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2801  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.18 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>