41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0130 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0130  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  525  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174648  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5330  hypothetical protein  67.69 
 
 
262 aa  330  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174175 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4840  filamentation induced by cAMP protein Fic  61.11 
 
 
272 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0212  filamentation induced by cAMP protein Fic  54.62 
 
 
258 aa  250  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.773085  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0478  hypothetical protein  53.85 
 
 
257 aa  245  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0588  hypothetical protein  50 
 
 
262 aa  189  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.622459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0872  hypothetical protein  46.48 
 
 
247 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4433  hypothetical protein  43.31 
 
 
249 aa  178  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4042  hypothetical protein  42.91 
 
 
249 aa  178  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4295  hypothetical protein  42.42 
 
 
343 aa  176  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.402555  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0320  hypothetical protein  44.75 
 
 
329 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.249889  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0264  hypothetical protein  42.02 
 
 
240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25360  hypothetical protein  40.59 
 
 
288 aa  143  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0073  hypothetical protein  44.61 
 
 
260 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5195  hypothetical protein  41.41 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000065198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3911  hypothetical protein  41.74 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13692  hypothetical protein  41.79 
 
 
256 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.31316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36000  hypothetical protein  39.92 
 
 
248 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14694  normal  0.163356 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0514  hypothetical protein  37.12 
 
 
251 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4894  hypothetical protein  41.41 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.270155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4808  hypothetical protein  41.41 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.449247  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5424  hypothetical protein  40.08 
 
 
263 aa  132  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1381  hypothetical protein  38.46 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  0.081162 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0727  heat repeat-containing PBS lyase  44.53 
 
 
254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.51 
 
 
412 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.25 
 
 
384 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3761  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.65 
 
 
430 aa  49.3  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  24.11 
 
 
348 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  33.62 
 
 
429 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  24.11 
 
 
348 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.23 
 
 
380 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  24.02 
 
 
359 aa  47  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2264  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.19 
 
 
384 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.1 
 
 
392 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.8 
 
 
412 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3978  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.87 
 
 
422 aa  45.8  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0676  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.68 
 
 
394 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  0.0136984 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5504  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.7 
 
 
394 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0732622  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  20.96 
 
 
367 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.56 
 
 
408 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.78 
 
 
384 aa  42  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>