43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25360 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_25360  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  552  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0212  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.7 
 
 
258 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.773085  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5330  hypothetical protein  42.49 
 
 
262 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174175 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0130  hypothetical protein  40.59 
 
 
270 aa  166  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0478  hypothetical protein  40.29 
 
 
257 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4840  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.46 
 
 
272 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0872  hypothetical protein  39.93 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4042  hypothetical protein  37.96 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4433  hypothetical protein  37 
 
 
249 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0588  hypothetical protein  40.08 
 
 
262 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.622459  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0514  hypothetical protein  37.94 
 
 
251 aa  109  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0320  hypothetical protein  35.93 
 
 
329 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.249889  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0073  hypothetical protein  39.15 
 
 
260 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13692  hypothetical protein  38.27 
 
 
256 aa  106  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.31316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5195  hypothetical protein  35.06 
 
 
246 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000065198 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4295  hypothetical protein  33.43 
 
 
343 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.402555  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4808  hypothetical protein  35.79 
 
 
246 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.449247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4894  hypothetical protein  35.79 
 
 
246 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.270155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1381  hypothetical protein  36.36 
 
 
248 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  0.081162 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3911  hypothetical protein  36.21 
 
 
245 aa  93.6  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0264  hypothetical protein  34.69 
 
 
240 aa  92.8  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5424  hypothetical protein  36.67 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36000  hypothetical protein  33.7 
 
 
248 aa  87  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14694  normal  0.163356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2801  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.98 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0727  heat repeat-containing PBS lyase  38.71 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.4 
 
 
412 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5504  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 
394 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0732622  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.78 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  37.72 
 
 
406 aa  50.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33230  hypothetical protein  33.62 
 
 
408 aa  50.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  22.5 
 
 
359 aa  48.9  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.47 
 
 
393 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3978  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.02 
 
 
422 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.25 
 
 
408 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.22 
 
 
367 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.62 
 
 
392 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.43 
 
 
400 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2285  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.07 
 
 
250 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3761  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.65 
 
 
430 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2529  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.78 
 
 
402 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.09 
 
 
393 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0044  filamentation induced by cAMP protein Fic  48.78 
 
 
419 aa  42.7  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.203132 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.08 
 
 
380 aa  42.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>