27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4808 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4808  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.449247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4894  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.270155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5195  hypothetical protein  98.37 
 
 
246 aa  467  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000065198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5424  hypothetical protein  77.87 
 
 
263 aa  325  5e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1381  hypothetical protein  76.15 
 
 
248 aa  315  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  0.081162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13692  hypothetical protein  68.8 
 
 
256 aa  288  7e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.31316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0264  hypothetical protein  57.32 
 
 
240 aa  247  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0514  hypothetical protein  57.2 
 
 
251 aa  247  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3911  hypothetical protein  59.59 
 
 
245 aa  245  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36000  hypothetical protein  55.69 
 
 
248 aa  219  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14694  normal  0.163356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0478  hypothetical protein  45.91 
 
 
257 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4042  hypothetical protein  47.66 
 
 
249 aa  172  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0212  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.4 
 
 
258 aa  169  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.773085  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4433  hypothetical protein  45.96 
 
 
249 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0130  hypothetical protein  41.41 
 
 
270 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174648  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5330  hypothetical protein  40.86 
 
 
262 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0588  hypothetical protein  49.79 
 
 
262 aa  149  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.622459  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4840  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.07 
 
 
272 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0872  hypothetical protein  43.27 
 
 
247 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0727  heat repeat-containing PBS lyase  49.47 
 
 
254 aa  136  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0073  hypothetical protein  40.23 
 
 
260 aa  99.8  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0320  hypothetical protein  31.62 
 
 
329 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.249889  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4295  hypothetical protein  35.71 
 
 
343 aa  92  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.402555  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25360  hypothetical protein  35.79 
 
 
288 aa  91.3  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2801  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.97 
 
 
300 aa  56.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  22.41 
 
 
359 aa  51.2  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.13 
 
 
367 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>