27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0514 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0514  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  483  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3911  hypothetical protein  61.63 
 
 		 245 aa  255  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0264  hypothetical protein  59.35 
 
 		 240 aa  241  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5195  hypothetical protein  56.38 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000065198 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13692  hypothetical protein  57.75 
 
 		 256 aa  228  5e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.31316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4808  hypothetical protein  56.5 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.449247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4894  hypothetical protein  56.5 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.270155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36000  hypothetical protein  57.96 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14694  normal  0.163356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1381  hypothetical protein  57.03 
 
 		 248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  0.081162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5424  hypothetical protein  59.18 
 
 		 263 aa  221  6e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0212  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.3 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.773085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4042  hypothetical protein  44.27 
 
 		 249 aa  159  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4433  hypothetical protein  43.95 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0478  hypothetical protein  39.77 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0130  hypothetical protein  37.12 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174648  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4840  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.03 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0872  hypothetical protein  43.51 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0588  hypothetical protein  45.8 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.622459  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0727  heat repeat-containing PBS lyase  50.8 
 
 		 254 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5330  hypothetical protein  37.45 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174175 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25360  hypothetical protein  37.94 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0320  hypothetical protein  35.68 
 
 		 329 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.249889  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0073  hypothetical protein  36.4 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4295  hypothetical protein  34.74 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.402555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2801  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.02 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.1 
 
 		 367 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3247  hypothetical protein  32.81 
 
 		 377 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199811  normal  0.982755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>