31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4042 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4042  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4433  hypothetical protein  93.17 
 
 		 249 aa  441  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0872  hypothetical protein  61.09 
 
 		 247 aa  244  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0212  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.1 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.773085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0130  hypothetical protein  42.91 
 
 		 270 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174648  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5330  hypothetical protein  43.2 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0478  hypothetical protein  46.09 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0264  hypothetical protein  48.54 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4840  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.56 
 
 		 272 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5195  hypothetical protein  46.38 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000065198 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0514  hypothetical protein  44.27 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4808  hypothetical protein  47.66 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.449247  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36000  hypothetical protein  46.67 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14694  normal  0.163356 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4894  hypothetical protein  47.66 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.270155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1381  hypothetical protein  46.91 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  0.081162 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3911  hypothetical protein  47.3 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5424  hypothetical protein  48.35 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0588  hypothetical protein  45.96 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.622459  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13692  hypothetical protein  43.75 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.31316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0320  hypothetical protein  37.14 
 
 		 329 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.249889  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4295  hypothetical protein  39.68 
 
 		 343 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.402555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25360  hypothetical protein  37.96 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0073  hypothetical protein  38.22 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0727  heat repeat-containing PBS lyase  43.81 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  34.58 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3761  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.77 
 
 		 430 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.04 
 
 		 412 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.27 
 
 		 384 aa  45.8  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.71 
 
 		 380 aa  45.4  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.85 
 
 		 412 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  31.25 
 
 		 429 aa  42  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>