25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0588 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0588  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  496  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.622459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0212  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.7 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.773085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5330  hypothetical protein  53.05 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0478  hypothetical protein  53.64 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0130  hypothetical protein  49.23 
 
 		 270 aa  221  9e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174648  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4840  filamentation induced by cAMP protein Fic  54.24 
 
 		 272 aa  219  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0872  hypothetical protein  52.36 
 
 		 247 aa  183  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0264  hypothetical protein  51.87 
 
 		 240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36000  hypothetical protein  53.06 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14694  normal  0.163356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4042  hypothetical protein  46.75 
 
 		 249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5195  hypothetical protein  49.79 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000065198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4433  hypothetical protein  46.31 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032509 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3911  hypothetical protein  49.08 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4894  hypothetical protein  50.62 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.270155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4808  hypothetical protein  50.62 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.449247  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0514  hypothetical protein  48.39 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1381  hypothetical protein  45.68 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  0.081162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13692  hypothetical protein  47.01 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.31316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4295  hypothetical protein  40.71 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.402555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5424  hypothetical protein  48.81 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0073  hypothetical protein  44.03 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0320  hypothetical protein  40.69 
 
 		 329 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.249889  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25360  hypothetical protein  40.94 
 
 		 288 aa  132  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0727  heat repeat-containing PBS lyase  47.56 
 
 		 254 aa  119  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2801  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.15 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>