222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0683 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0683  rhodanese superfamily protein  100 
 
 		 248 aa  505  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.463149  normal  0.58042 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2404  rhodanese superfamily protein  72.24 
 
 		 287 aa  367  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2009  rhodanese superfamily protein  71.84 
 
 		 287 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807914  normal  0.757941 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2206  rhodanese superfamily protein  69.8 
 
 		 282 aa  352  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2535  rhodanese superfamily protein  67.76 
 
 		 282 aa  347  9e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574303  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0753  rhodanese superfamily protein  67.34 
 
 		 282 aa  345  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5656  rhodanese superfamily protein  65.71 
 
 		 284 aa  323  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1702  rhodanese superfamily protein  65.31 
 
 		 334 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2314  rhodanese superfamily protein  65.31 
 
 		 284 aa  321  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3293  rhodanese superfamily protein  63.67 
 
 		 287 aa  321  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2337  rhodanese superfamily protein  65.31 
 
 		 284 aa  321  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.933613  normal  0.0128371 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0963  rhodanese superfamily protein  64.78 
 
 		 339 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.197829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1252  rhodanese superfamily protein  64.08 
 
 		 287 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3119  Rhodanese domain protein  65.55 
 
 		 263 aa  314  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1204  rhodanese superfamily protein  64.08 
 
 		 299 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.521116  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1914  rhodanese superfamily protein  63.67 
 
 		 299 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0100807  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2233  rhodanese superfamily protein  63.27 
 
 		 284 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1354  rhodanese superfamily protein  63.67 
 
 		 299 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0983  rhodanese superfamily protein  63.67 
 
 		 333 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2353  rhodanese superfamily protein  63.27 
 
 		 284 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0478331  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1042  rhodanese superfamily protein  63.67 
 
 		 299 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0826  rhodanese superfamily protein  63.67 
 
 		 299 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.56708  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1196  rhodanese superfamily protein  63.67 
 
 		 299 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.760929  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0325  rhodanese superfamily protein  63.67 
 
 		 299 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.605661  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2080  rhodanese superfamily protein  61.63 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0163849  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4043  rhodanese domain-containing protein  62.87 
 
 		 263 aa  301  8.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0638463 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3026  rhodanese domain-containing protein  60.74 
 
 		 257 aa  292  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2926  rhodanese superfamily protein  59.34 
 
 		 253 aa  289  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2894  rhodanese superfamily protein  59.11 
 
 		 261 aa  285  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0981  rhodanese domain-containing protein  59.58 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2877  hypothetical protein  57.08 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0484  rhodanese domain-containing protein  53.53 
 
 		 260 aa  274  9e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1325  Rhodanese domain protein  53.11 
 
 		 258 aa  268  5e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00765763  hitchhiker  1.3347e-18 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01514  rhodanese superfamily protein  51.25 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249305  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2178  rhodanese superfamily protein  50 
 
 		 266 aa  236  3e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.258841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2090  rhodanese superfamily protein  50 
 
 		 257 aa  233  3e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  47.93 
 
 		 623 aa  217  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0473  rhodanese-related sulfurtransferase  44.77 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1694  putative sulfurtransferase  44.35 
 
 		 237 aa  208  7e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1437  rhodanese superfamily protein  50.21 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  45.2 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  49.58 
 
 		 312 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  44.8 
 
 		 302 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  49.17 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  47.7 
 
 		 312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  44.8 
 
 		 294 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  46.03 
 
 		 317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3915  rhodanese domain-containing protein  46.09 
 
 		 257 aa  194  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  46.47 
 
 		 310 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  46.38 
 
 		 306 aa  194  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  46.28 
 
 		 310 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  45.61 
 
 		 317 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  44.81 
 
 		 323 aa  192  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  46.44 
 
 		 310 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  45.96 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1349  hypothetical protein  45.64 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  45.19 
 
 		 313 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  45.61 
 
 		 314 aa  187  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  43.98 
 
 		 337 aa  187  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  43.98 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  43.98 
 
 		 330 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  43.57 
 
 		 333 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2750  hypothetical protein  40.42 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  40 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  43.57 
 
 		 330 aa  185  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  44.4 
 
 		 309 aa  185  6e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0147  rhodanese-like protein  42.45 
 
 		 242 aa  185  7e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.744417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1892  rhodanese-like protein  43.8 
 
 		 269 aa  184  8e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  41.88 
 
 		 328 aa  184  9e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  42.32 
 
 		 341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1939  rhodanese domain-containing protein  43.37 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1781  hypothetical protein  44.44 
 
 		 326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  42.5 
 
 		 336 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3659  rhodanese domain-containing protein  44.17 
 
 		 322 aa  182  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  42.74 
 
 		 334 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  42.74 
 
 		 334 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3429  rhodanese-like protein  46.15 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  43.98 
 
 		 331 aa  182  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  42.74 
 
 		 334 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0878  hypothetical protein  44.64 
 
 		 332 aa  181  7e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000330025  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  42.74 
 
 		 334 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  43.15 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  43.16 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  42.74 
 
 		 326 aa  180  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4255  rhodanese domain-containing protein  44.21 
 
 		 305 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0086  rhodanese family protein  43.78 
 
 		 308 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0081  rhodanese family protein  43.78 
 
 		 305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  42.32 
 
 		 334 aa  179  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  42.08 
 
 		 327 aa  177  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0011  rhodanese-like protein  43.1 
 
 		 301 aa  177  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.921465 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2660  rhodanese domain-containing protein  41.08 
 
 		 326 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  normal  0.0411957 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3418  rhodanese domain-containing protein  44.12 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0529326  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2937  rhodanese-like protein  43.15 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0850  rhodanese domain-containing protein  45.64 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  42.74 
 
 		 326 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0216  hypothetical protein  42.31 
 
 		 326 aa  175  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32074  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1973  rhodanese domain-containing protein  41.8 
 
 		 332 aa  174  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000137009  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1961  rhodanese-like protein  44.77 
 
 		 319 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1535  hypothetical protein  43.59 
 
 		 350 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  42.31 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>