222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2404 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2404  rhodanese superfamily protein  100 
 
 		 287 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2009  rhodanese superfamily protein  97.56 
 
 		 287 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807914  normal  0.757941 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2206  rhodanese superfamily protein  90.04 
 
 		 282 aa  530  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2535  rhodanese superfamily protein  77.66 
 
 		 282 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574303  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0753  rhodanese superfamily protein  75.18 
 
 		 282 aa  455  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1702  rhodanese superfamily protein  65.36 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0963  rhodanese superfamily protein  66.91 
 
 		 339 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.197829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2337  rhodanese superfamily protein  65.82 
 
 		 284 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.933613  normal  0.0128371 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3293  rhodanese superfamily protein  63.29 
 
 		 287 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2314  rhodanese superfamily protein  65.7 
 
 		 284 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5656  rhodanese superfamily protein  66.18 
 
 		 284 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2233  rhodanese superfamily protein  65.09 
 
 		 284 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0983  rhodanese superfamily protein  64.34 
 
 		 333 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1252  rhodanese superfamily protein  61.89 
 
 		 287 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2353  rhodanese superfamily protein  65.09 
 
 		 284 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0478331  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1914  rhodanese superfamily protein  64.26 
 
 		 299 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0100807  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1354  rhodanese superfamily protein  64.26 
 
 		 299 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1042  rhodanese superfamily protein  64.26 
 
 		 299 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0826  rhodanese superfamily protein  64.26 
 
 		 299 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.56708  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1196  rhodanese superfamily protein  64.26 
 
 		 299 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.760929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1204  rhodanese superfamily protein  63.9 
 
 		 299 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.521116  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0325  rhodanese superfamily protein  64.26 
 
 		 299 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.605661  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0683  rhodanese superfamily protein  72.24 
 
 		 248 aa  367  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.463149  normal  0.58042 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2080  rhodanese superfamily protein  59.57 
 
 		 327 aa  352  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0163849  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3119  Rhodanese domain protein  65.97 
 
 		 263 aa  322  4e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2894  rhodanese superfamily protein  64.46 
 
 		 261 aa  322  5e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0484  rhodanese domain-containing protein  59.18 
 
 		 260 aa  317  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4043  rhodanese domain-containing protein  64.98 
 
 		 263 aa  316  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0638463 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2926  rhodanese superfamily protein  61.83 
 
 		 253 aa  316  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1325  Rhodanese domain protein  59.66 
 
 		 258 aa  308  5.9999999999999995e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00765763  hitchhiker  1.3347e-18 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3026  rhodanese domain-containing protein  62.6 
 
 		 257 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2877  hypothetical protein  59.17 
 
 		 247 aa  301  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0981  rhodanese domain-containing protein  59.58 
 
 		 247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  49.63 
 
 		 623 aa  266  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01514  rhodanese superfamily protein  55.23 
 
 		 253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249305  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2178  rhodanese superfamily protein  51.45 
 
 		 266 aa  249  5e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.258841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2090  rhodanese superfamily protein  51.45 
 
 		 257 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  47.02 
 
 		 310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  47.37 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  47.72 
 
 		 312 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  45.22 
 
 		 323 aa  242  3.9999999999999997e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  46.5 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  47.62 
 
 		 310 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  47.37 
 
 		 312 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  45.61 
 
 		 317 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1349  hypothetical protein  47.25 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1437  rhodanese superfamily protein  54.17 
 
 		 255 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  45.26 
 
 		 323 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  43.73 
 
 		 352 aa  235  7e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  44.91 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  45.88 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  44.09 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  45.26 
 
 		 313 aa  232  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  44.56 
 
 		 314 aa  232  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  44.24 
 
 		 336 aa  232  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1781  hypothetical protein  44.53 
 
 		 326 aa  228  7e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0216  hypothetical protein  43.01 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32074  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  44.44 
 
 		 326 aa  225  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0473  rhodanese-related sulfurtransferase  48.12 
 
 		 237 aa  225  7e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  43.8 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  43.64 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  44.16 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1694  putative sulfurtransferase  47.7 
 
 		 237 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  42.32 
 
 		 328 aa  223  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  43.8 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  43.8 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  43.8 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 		 331 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  43.59 
 
 		 333 aa  222  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  43.96 
 
 		 330 aa  221  7e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  42.29 
 
 		 306 aa  222  7e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  43.96 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  43.37 
 
 		 326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  42.45 
 
 		 337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  43.88 
 
 		 341 aa  219  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1973  rhodanese domain-containing protein  42.96 
 
 		 332 aa  219  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000137009  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  41.07 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1535  hypothetical protein  43.01 
 
 		 350 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  41.07 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  42.34 
 
 		 326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  40.71 
 
 		 294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  42.46 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2660  rhodanese domain-containing protein  41.61 
 
 		 326 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  normal  0.0411957 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  43.73 
 
 		 339 aa  215  8e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0878  hypothetical protein  42.65 
 
 		 332 aa  211  7.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000330025  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  41.16 
 
 		 327 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  40.64 
 
 		 555 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3429  rhodanese-like protein  42.34 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3823  hypothetical protein  41.18 
 
 		 314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3915  rhodanese domain-containing protein  45.08 
 
 		 257 aa  196  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1091  rhodanese-like domain-containing protein  41.04 
 
 		 305 aa  193  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2782  rhodanese domain-containing protein  40.5 
 
 		 315 aa  192  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1939  rhodanese domain-containing protein  38.11 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2937  rhodanese-like protein  37.98 
 
 		 316 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751975  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2750  hypothetical protein  39.18 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  38.78 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0850  rhodanese domain-containing protein  40.83 
 
 		 322 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3401  Rhodanese domain protein  39.71 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4255  rhodanese domain-containing protein  39.71 
 
 		 305 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0081  rhodanese family protein  39.34 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>