216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0484 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0484  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 260 aa  539  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1325  Rhodanese domain protein  88.24 
 
 		 258 aa  475  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00765763  hitchhiker  1.3347e-18 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2009  rhodanese superfamily protein  60.08 
 
 		 287 aa  321  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807914  normal  0.757941 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2404  rhodanese superfamily protein  59.18 
 
 		 287 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2894  rhodanese superfamily protein  60.34 
 
 		 261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1702  rhodanese superfamily protein  58.47 
 
 		 334 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2206  rhodanese superfamily protein  60.17 
 
 		 282 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3026  rhodanese domain-containing protein  60.42 
 
 		 257 aa  309  4e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0753  rhodanese superfamily protein  59.66 
 
 		 282 aa  308  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2337  rhodanese superfamily protein  59.26 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.933613  normal  0.0128371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2535  rhodanese superfamily protein  60.5 
 
 		 282 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574303  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2314  rhodanese superfamily protein  59.26 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5656  rhodanese superfamily protein  58.44 
 
 		 284 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2233  rhodanese superfamily protein  57.61 
 
 		 284 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2353  rhodanese superfamily protein  57.61 
 
 		 284 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0478331  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0983  rhodanese superfamily protein  55.87 
 
 		 333 aa  300  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2877  hypothetical protein  55.79 
 
 		 247 aa  300  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0963  rhodanese superfamily protein  57.66 
 
 		 339 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.197829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2926  rhodanese superfamily protein  56.72 
 
 		 253 aa  298  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2080  rhodanese superfamily protein  56.61 
 
 		 327 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0163849  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0981  rhodanese domain-containing protein  59.24 
 
 		 247 aa  296  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1914  rhodanese superfamily protein  55.79 
 
 		 299 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0100807  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1354  rhodanese superfamily protein  55.79 
 
 		 299 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1042  rhodanese superfamily protein  55.79 
 
 		 299 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0826  rhodanese superfamily protein  55.79 
 
 		 299 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.56708  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1196  rhodanese superfamily protein  55.79 
 
 		 299 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.760929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1204  rhodanese superfamily protein  55.79 
 
 		 299 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.521116  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0325  rhodanese superfamily protein  55.79 
 
 		 299 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.605661  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1252  rhodanese superfamily protein  56.79 
 
 		 287 aa  292  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3293  rhodanese superfamily protein  55.97 
 
 		 287 aa  290  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3119  Rhodanese domain protein  56.67 
 
 		 263 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4043  rhodanese domain-containing protein  55.1 
 
 		 263 aa  285  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0638463 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0683  rhodanese superfamily protein  53.53 
 
 		 248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.463149  normal  0.58042 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01514  rhodanese superfamily protein  50.83 
 
 		 253 aa  251  8.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249305  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  48.81 
 
 		 623 aa  238  8e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1437  rhodanese superfamily protein  49.39 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2090  rhodanese superfamily protein  46.67 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2178  rhodanese superfamily protein  46.25 
 
 		 266 aa  224  9e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.258841  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0473  rhodanese-related sulfurtransferase  41.1 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1694  putative sulfurtransferase  40.68 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3915  rhodanese domain-containing protein  42.32 
 
 		 257 aa  191  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  39.92 
 
 		 328 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2750  hypothetical protein  37.14 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  39 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  41.56 
 
 		 326 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  41.08 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  41.15 
 
 		 326 aa  181  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  36.73 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  40.66 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  39.29 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  39.43 
 
 		 317 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  41.25 
 
 		 339 aa  180  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1349  hypothetical protein  40.66 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  40.08 
 
 		 304 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  40.08 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1961  rhodanese-like protein  41.8 
 
 		 319 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  39.43 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  41.28 
 
 		 306 aa  178  8e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  38.08 
 
 		 314 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  40.66 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  40.74 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  40.74 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  40.74 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  40.25 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2937  rhodanese-like protein  39.18 
 
 		 316 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751975  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  39 
 
 		 317 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  39.67 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  39.27 
 
 		 352 aa  175  6e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  39.83 
 
 		 305 aa  175  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  40.33 
 
 		 334 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  38.52 
 
 		 323 aa  175  7e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  38.87 
 
 		 352 aa  175  7e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1939  rhodanese domain-containing protein  39.59 
 
 		 316 aa  175  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0216  hypothetical protein  39.09 
 
 		 326 aa  173  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32074  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  39.92 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  39.92 
 
 		 309 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  39.51 
 
 		 334 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  39.09 
 
 		 326 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1781  hypothetical protein  39.09 
 
 		 326 aa  172  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  39.09 
 
 		 330 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  38.27 
 
 		 327 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  39.04 
 
 		 337 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  39.26 
 
 		 312 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1973  rhodanese domain-containing protein  38.68 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000137009  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  38.59 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2660  rhodanese domain-containing protein  38.27 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  normal  0.0411957 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  38.68 
 
 		 331 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  39.09 
 
 		 330 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  38.68 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1091  rhodanese-like domain-containing protein  37.55 
 
 		 305 aa  169  3e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  38.91 
 
 		 312 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  37.4 
 
 		 555 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1535  hypothetical protein  40.68 
 
 		 350 aa  168  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1892  rhodanese-like protein  38.02 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0878  hypothetical protein  39.08 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000330025  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1677  rhodanese domain-containing protein  39.75 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0147  rhodanese-like protein  36.67 
 
 		 242 aa  166  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.744417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3401  Rhodanese domain protein  38.49 
 
 		 309 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3699  Rhodanese domain protein  38.49 
 
 		 309 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0011  rhodanese-like protein  37.65 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.921465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>