215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3026 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3026  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
257 aa  528  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4043  rhodanese domain-containing protein  74.6 
 
 
263 aa  371  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0638463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3119  Rhodanese domain protein  71.55 
 
 
263 aa  344  8e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0981  rhodanese domain-containing protein  67.36 
 
 
247 aa  326  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2894  rhodanese superfamily protein  66.53 
 
 
261 aa  322  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2535  rhodanese superfamily protein  62.81 
 
 
282 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574303  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2877  hypothetical protein  63.6 
 
 
247 aa  310  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0963  rhodanese superfamily protein  63.27 
 
 
339 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.197829  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0484  rhodanese domain-containing protein  60.42 
 
 
260 aa  309  4e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2404  rhodanese superfamily protein  62.6 
 
 
287 aa  306  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954244  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2233  rhodanese superfamily protein  62.3 
 
 
284 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1325  Rhodanese domain protein  61.25 
 
 
258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00765763  hitchhiker  1.3347e-18 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0753  rhodanese superfamily protein  63.22 
 
 
282 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2353  rhodanese superfamily protein  62.3 
 
 
284 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0478331  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5656  rhodanese superfamily protein  62.7 
 
 
284 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2009  rhodanese superfamily protein  61.79 
 
 
287 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807914  normal  0.757941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1702  rhodanese superfamily protein  61.89 
 
 
334 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2314  rhodanese superfamily protein  61.89 
 
 
284 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2337  rhodanese superfamily protein  61.89 
 
 
284 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.933613  normal  0.0128371 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1914  rhodanese superfamily protein  61.63 
 
 
299 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0100807  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1354  rhodanese superfamily protein  61.63 
 
 
299 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1042  rhodanese superfamily protein  61.63 
 
 
299 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0826  rhodanese superfamily protein  61.63 
 
 
299 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.56708  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1196  rhodanese superfamily protein  61.63 
 
 
299 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.760929  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0325  rhodanese superfamily protein  61.63 
 
 
299 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.605661  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1204  rhodanese superfamily protein  61.22 
 
 
299 aa  298  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.521116  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1252  rhodanese superfamily protein  60.16 
 
 
287 aa  297  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654472  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2206  rhodanese superfamily protein  62.81 
 
 
282 aa  296  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3293  rhodanese superfamily protein  59.35 
 
 
287 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2926  rhodanese superfamily protein  61.11 
 
 
253 aa  295  5e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2080  rhodanese superfamily protein  59.51 
 
 
327 aa  294  9e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0163849  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0683  rhodanese superfamily protein  60.74 
 
 
248 aa  292  4e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.463149  normal  0.58042 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0983  rhodanese superfamily protein  60.82 
 
 
333 aa  292  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01514  rhodanese superfamily protein  52.52 
 
 
253 aa  239  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249305  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2090  rhodanese superfamily protein  51.68 
 
 
257 aa  227  2e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2178  rhodanese superfamily protein  51.26 
 
 
266 aa  226  3e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.258841  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1437  rhodanese superfamily protein  50.4 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15403  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  48.76 
 
 
623 aa  211  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0473  rhodanese-related sulfurtransferase  42.37 
 
 
237 aa  195  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1694  putative sulfurtransferase  41.95 
 
 
237 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3915  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  43.21 
 
 
312 aa  181  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2937  rhodanese-like protein  43.43 
 
 
316 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751975  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  41.95 
 
 
317 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1961  rhodanese-like protein  45 
 
 
319 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  42.13 
 
 
313 aa  171  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  42.55 
 
 
312 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  41.7 
 
 
310 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  41.28 
 
 
310 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  41.7 
 
 
310 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  40.43 
 
 
317 aa  168  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  42.13 
 
 
312 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  41.41 
 
 
309 aa  168  9e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  42.29 
 
 
323 aa  168  9e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1349  hypothetical protein  41.28 
 
 
310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  38.03 
 
 
254 aa  165  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0147  rhodanese-like protein  41.48 
 
 
242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.744417  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  38.27 
 
 
336 aa  162  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1939  rhodanese domain-containing protein  41.32 
 
 
316 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3699  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 
309 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2750  hypothetical protein  38.03 
 
 
254 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  40.97 
 
 
305 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2196  hypothetical protein  42.32 
 
 
255 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4255  rhodanese domain-containing protein  40.51 
 
 
305 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0081  rhodanese family protein  40.51 
 
 
305 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
306 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  42.15 
 
 
555 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0086  rhodanese family protein  40.51 
 
 
308 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  38.59 
 
 
314 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  38.82 
 
 
294 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  38.26 
 
 
304 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  38.26 
 
 
302 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3401  Rhodanese domain protein  40.34 
 
 
309 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1091  rhodanese-like domain-containing protein  39.75 
 
 
305 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2782  rhodanese domain-containing protein  38.36 
 
 
315 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1973  rhodanese domain-containing protein  37.34 
 
 
332 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000137009  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  37.44 
 
 
328 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  38.24 
 
 
323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2998  rhodanese-like sulfurtransferase  38.84 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317205  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1892  rhodanese-like protein  42.17 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0216  hypothetical protein  37.97 
 
 
326 aa  152  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32074  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1135  rhodanese domain-containing protein  38.02 
 
 
275 aa  152  5e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1677  rhodanese domain-containing protein  40.52 
 
 
311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3418  rhodanese domain-containing protein  41.56 
 
 
317 aa  151  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0529326  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  38.59 
 
 
331 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0011  rhodanese-like protein  39.21 
 
 
301 aa  150  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.921465 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 
339 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  35.37 
 
 
337 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  35.54 
 
 
352 aa  149  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  37.89 
 
 
326 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  38.02 
 
 
333 aa  149  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1078  rhodanese-like protein  39.26 
 
 
255 aa  149  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0473759  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  35.12 
 
 
352 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  37.72 
 
 
326 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0206  rhodanese-like protein  35.15 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  37.34 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3659  rhodanese domain-containing protein  41.81 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3823  hypothetical protein  39.04 
 
 
314 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  38.63 
 
 
326 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  37.34 
 
 
330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>