225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1437 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1437  rhodanese superfamily protein  100 
 
 
255 aa  523  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15403  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01514  rhodanese superfamily protein  67.34 
 
 
253 aa  342  5e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249305  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2178  rhodanese superfamily protein  63.11 
 
 
266 aa  317  1e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.258841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2090  rhodanese superfamily protein  63.11 
 
 
257 aa  315  3e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2404  rhodanese superfamily protein  54.17 
 
 
287 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954244  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2206  rhodanese superfamily protein  54.17 
 
 
282 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2009  rhodanese superfamily protein  53.09 
 
 
287 aa  250  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807914  normal  0.757941 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2877  hypothetical protein  54.17 
 
 
247 aa  247  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3119  Rhodanese domain protein  56.41 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2894  rhodanese superfamily protein  53.31 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1702  rhodanese superfamily protein  52.46 
 
 
334 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2314  rhodanese superfamily protein  52.46 
 
 
284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2337  rhodanese superfamily protein  52.46 
 
 
284 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.933613  normal  0.0128371 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0753  rhodanese superfamily protein  51.85 
 
 
282 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5656  rhodanese superfamily protein  52.05 
 
 
284 aa  241  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2233  rhodanese superfamily protein  52.46 
 
 
284 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2353  rhodanese superfamily protein  52.46 
 
 
284 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0478331  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0484  rhodanese domain-containing protein  49.39 
 
 
260 aa  240  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2926  rhodanese superfamily protein  50.21 
 
 
253 aa  240  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0963  rhodanese superfamily protein  51.42 
 
 
339 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.197829  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1252  rhodanese superfamily protein  50.82 
 
 
287 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654472  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4043  rhodanese domain-containing protein  53.36 
 
 
263 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0638463 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2535  rhodanese superfamily protein  49.38 
 
 
282 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574303  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3293  rhodanese superfamily protein  50 
 
 
287 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1204  rhodanese superfamily protein  51.02 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.521116  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1914  rhodanese superfamily protein  50.61 
 
 
299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0100807  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1354  rhodanese superfamily protein  50.61 
 
 
299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2080  rhodanese superfamily protein  50.41 
 
 
327 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0163849  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1042  rhodanese superfamily protein  50.61 
 
 
299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0826  rhodanese superfamily protein  50.61 
 
 
299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.56708  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1196  rhodanese superfamily protein  50.61 
 
 
299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.760929  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0325  rhodanese superfamily protein  50.61 
 
 
299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.605661  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1325  Rhodanese domain protein  49.58 
 
 
258 aa  233  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00765763  hitchhiker  1.3347e-18 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0983  rhodanese superfamily protein  50.61 
 
 
333 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0981  rhodanese domain-containing protein  49.79 
 
 
247 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0683  rhodanese superfamily protein  50.21 
 
 
248 aa  224  8e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.463149  normal  0.58042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3026  rhodanese domain-containing protein  50.4 
 
 
257 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0473  rhodanese-related sulfurtransferase  43.51 
 
 
237 aa  199  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1694  putative sulfurtransferase  43.1 
 
 
237 aa  198  7.999999999999999e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  43.8 
 
 
623 aa  192  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  39.55 
 
 
294 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  34.96 
 
 
254 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  39.74 
 
 
334 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  39.74 
 
 
334 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1135  rhodanese domain-containing protein  36.97 
 
 
275 aa  152  4e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2750  hypothetical protein  35.37 
 
 
254 aa  152  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  39.74 
 
 
334 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  38.27 
 
 
306 aa  152  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  38.17 
 
 
323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  36.67 
 
 
302 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  39.74 
 
 
334 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  39.32 
 
 
334 aa  152  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  36.25 
 
 
304 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0216  hypothetical protein  37.55 
 
 
326 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32074  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  38.59 
 
 
309 aa  149  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3631  hypothetical protein  36.4 
 
 
312 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  37.97 
 
 
330 aa  149  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  37.5 
 
 
312 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  37.55 
 
 
314 aa  149  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  37.55 
 
 
330 aa  148  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  37.13 
 
 
333 aa  148  9e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  37.86 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  38.43 
 
 
339 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  36.67 
 
 
310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0476  hypothetical protein  35.66 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.217138  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  35.15 
 
 
323 aa  145  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  37.08 
 
 
312 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 
328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  36.67 
 
 
310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  36.29 
 
 
333 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1736  hypothetical protein  31.93 
 
 
319 aa  145  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.367916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3915  rhodanese domain-containing protein  38.67 
 
 
257 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  38.01 
 
 
305 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1961  rhodanese-like protein  39.43 
 
 
319 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  37.82 
 
 
326 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  35.83 
 
 
336 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1349  hypothetical protein  36.67 
 
 
310 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  38.24 
 
 
326 aa  142  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1973  rhodanese domain-containing protein  36.21 
 
 
332 aa  142  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000137009  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2770  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  142  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.302608  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  37.45 
 
 
326 aa  142  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2713  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  142  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0311305  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  35.83 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1464  hypothetical protein  31.38 
 
 
324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0473945  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1781  hypothetical protein  35.44 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  35.17 
 
 
313 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1961  hypothetical protein  31.51 
 
 
319 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.564375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  35.86 
 
 
317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2660  rhodanese domain-containing protein  36.75 
 
 
326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  normal  0.0411957 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1989  hypothetical protein  31.51 
 
 
319 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1939  rhodanese domain-containing protein  37.7 
 
 
316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  34.69 
 
 
341 aa  139  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  35.86 
 
 
317 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3469  hypothetical protein  31.51 
 
 
319 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000879156  hitchhiker  0.000000000000171941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2937  rhodanese-like protein  37.6 
 
 
316 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751975  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0147  rhodanese-like protein  36.78 
 
 
242 aa  139  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.744417  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  35.25 
 
 
327 aa  139  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3348  rhodanese domain protein  38.37 
 
 
313 aa  139  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.305803  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1892  rhodanese-like protein  38.81 
 
 
269 aa  138  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0011  rhodanese-like protein  35.22 
 
 
301 aa  137  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.921465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>