209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3119 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3119  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 263 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4043  rhodanese domain-containing protein  71.37 
 
 		 263 aa  352  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0638463 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3026  rhodanese domain-containing protein  70.9 
 
 		 257 aa  348  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2894  rhodanese superfamily protein  68.05 
 
 		 261 aa  334  9e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3293  rhodanese superfamily protein  65.56 
 
 		 287 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1252  rhodanese superfamily protein  65.98 
 
 		 287 aa  328  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2926  rhodanese superfamily protein  64.32 
 
 		 253 aa  325  4.0000000000000003e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2404  rhodanese superfamily protein  65.69 
 
 		 287 aa  324  9e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2009  rhodanese superfamily protein  65.97 
 
 		 287 aa  322  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807914  normal  0.757941 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5656  rhodanese superfamily protein  66.53 
 
 		 284 aa  322  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0963  rhodanese superfamily protein  64.06 
 
 		 339 aa  322  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.197829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0753  rhodanese superfamily protein  64.29 
 
 		 282 aa  319  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1702  rhodanese superfamily protein  64.9 
 
 		 334 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2314  rhodanese superfamily protein  65.7 
 
 		 284 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2353  rhodanese superfamily protein  65.7 
 
 		 284 aa  318  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0478331  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2233  rhodanese superfamily protein  65.7 
 
 		 284 aa  318  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2337  rhodanese superfamily protein  65.7 
 
 		 284 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.933613  normal  0.0128371 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2877  hypothetical protein  65.13 
 
 		 247 aa  318  6e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1914  rhodanese superfamily protein  64.31 
 
 		 299 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0100807  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1354  rhodanese superfamily protein  64.31 
 
 		 299 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1042  rhodanese superfamily protein  64.31 
 
 		 299 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0826  rhodanese superfamily protein  64.31 
 
 		 299 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.56708  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1196  rhodanese superfamily protein  64.31 
 
 		 299 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.760929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1204  rhodanese superfamily protein  64.31 
 
 		 299 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.521116  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0325  rhodanese superfamily protein  64.31 
 
 		 299 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.605661  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0983  rhodanese superfamily protein  63.32 
 
 		 333 aa  316  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2535  rhodanese superfamily protein  63.45 
 
 		 282 aa  315  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574303  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0683  rhodanese superfamily protein  65.55 
 
 		 248 aa  315  6e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.463149  normal  0.58042 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2206  rhodanese superfamily protein  64.71 
 
 		 282 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2080  rhodanese superfamily protein  62.75 
 
 		 327 aa  307  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0163849  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0981  rhodanese domain-containing protein  62.18 
 
 		 247 aa  297  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1325  Rhodanese domain protein  57.2 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00765763  hitchhiker  1.3347e-18 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0484  rhodanese domain-containing protein  55.2 
 
 		 260 aa  290  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2090  rhodanese superfamily protein  54.85 
 
 		 257 aa  248  9e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2178  rhodanese superfamily protein  54.43 
 
 		 266 aa  247  1e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.258841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01514  rhodanese superfamily protein  54.43 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249305  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1437  rhodanese superfamily protein  56.41 
 
 		 255 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0473  rhodanese-related sulfurtransferase  46.19 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  45.63 
 
 		 623 aa  212  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1694  putative sulfurtransferase  45.76 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  45.68 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  44.21 
 
 		 317 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  43.63 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  44.13 
 
 		 310 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  43.39 
 
 		 317 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  43.98 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  44.21 
 
 		 313 aa  182  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  43.75 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  44.63 
 
 		 310 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3915  rhodanese domain-containing protein  43.09 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  43.8 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1349  hypothetical protein  43.8 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0147  rhodanese-like protein  42.98 
 
 		 242 aa  176  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.744417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2937  rhodanese-like protein  41.27 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  38.31 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1961  rhodanese-like protein  40.81 
 
 		 319 aa  169  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  36.78 
 
 		 254 aa  168  6e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1892  rhodanese-like protein  43.1 
 
 		 269 aa  168  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  40.5 
 
 		 326 aa  168  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0216  hypothetical protein  38.15 
 
 		 326 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32074  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  39.52 
 
 		 309 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2750  hypothetical protein  37.19 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  39.18 
 
 		 336 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  40.5 
 
 		 304 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  40.34 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  40.5 
 
 		 302 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  42.55 
 
 		 306 aa  165  6.9999999999999995e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  39.92 
 
 		 323 aa  165  9e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  36.08 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  39.59 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  39.26 
 
 		 326 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  40.41 
 
 		 337 aa  161  8.000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  40.74 
 
 		 555 aa  161  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1677  rhodanese domain-containing protein  41.6 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1939  rhodanese domain-containing protein  39.44 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3348  rhodanese domain protein  42.55 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.305803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3418  rhodanese domain-containing protein  40.49 
 
 		 317 aa  159  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0529326  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0011  rhodanese-like protein  38.98 
 
 		 301 aa  158  8e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.921465 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  39.36 
 
 		 331 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  40 
 
 		 305 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  39.52 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2782  rhodanese domain-containing protein  39.83 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4255  rhodanese domain-containing protein  40.25 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0081  rhodanese family protein  40.68 
 
 		 305 aa  155  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  38.43 
 
 		 327 aa  155  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0086  rhodanese family protein  40.68 
 
 		 308 aa  155  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2998  rhodanese-like sulfurtransferase  40.33 
 
 		 255 aa  154  9e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  39.11 
 
 		 330 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  39.11 
 
 		 330 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0850  rhodanese domain-containing protein  40.91 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1781  hypothetical protein  37.9 
 
 		 326 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  38.71 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0654  rhodanese-like  35.27 
 
 		 319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.597958  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1973  rhodanese domain-containing protein  37.82 
 
 		 332 aa  152  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000137009  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1091  rhodanese-like domain-containing protein  39.66 
 
 		 305 aa  152  5e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14861  sulfurtransferase  35.68 
 
 		 319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.612505 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  36.93 
 
 		 352 aa  151  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3659  rhodanese domain-containing protein  40.49 
 
 		 322 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  37.66 
 
 		 352 aa  150  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>