226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2337 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2337  rhodanese superfamily protein  100 
 
 
284 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.933613  normal  0.0128371 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1702  rhodanese superfamily protein  99.65 
 
 
334 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2314  rhodanese superfamily protein  99.65 
 
 
284 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2233  rhodanese superfamily protein  97.45 
 
 
284 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2353  rhodanese superfamily protein  97.45 
 
 
284 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0478331  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5656  rhodanese superfamily protein  96.32 
 
 
284 aa  552  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0963  rhodanese superfamily protein  94.91 
 
 
339 aa  543  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.197829  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0983  rhodanese superfamily protein  89.89 
 
 
333 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1914  rhodanese superfamily protein  89.89 
 
 
299 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0100807  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1354  rhodanese superfamily protein  89.89 
 
 
299 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1042  rhodanese superfamily protein  89.89 
 
 
299 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0826  rhodanese superfamily protein  89.89 
 
 
299 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.56708  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1196  rhodanese superfamily protein  89.89 
 
 
299 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.760929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1204  rhodanese superfamily protein  89.89 
 
 
299 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.521116  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0325  rhodanese superfamily protein  89.89 
 
 
299 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.605661  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3293  rhodanese superfamily protein  81.69 
 
 
287 aa  500  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1252  rhodanese superfamily protein  81.69 
 
 
287 aa  498  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654472  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2080  rhodanese superfamily protein  83.03 
 
 
327 aa  488  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0163849  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0753  rhodanese superfamily protein  68.31 
 
 
282 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2535  rhodanese superfamily protein  68.95 
 
 
282 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574303  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2009  rhodanese superfamily protein  66.19 
 
 
287 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807914  normal  0.757941 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2404  rhodanese superfamily protein  65.83 
 
 
287 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954244  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2206  rhodanese superfamily protein  64.08 
 
 
282 aa  374  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0683  rhodanese superfamily protein  65.31 
 
 
248 aa  322  5e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.463149  normal  0.58042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3119  Rhodanese domain protein  65.98 
 
 
263 aa  317  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0484  rhodanese domain-containing protein  59.26 
 
 
260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2894  rhodanese superfamily protein  58.89 
 
 
261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3026  rhodanese domain-containing protein  61.89 
 
 
257 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1325  Rhodanese domain protein  57.85 
 
 
258 aa  294  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00765763  hitchhiker  1.3347e-18 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0981  rhodanese domain-containing protein  60.41 
 
 
247 aa  292  5e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2926  rhodanese superfamily protein  54.55 
 
 
253 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2877  hypothetical protein  54.29 
 
 
247 aa  276  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4043  rhodanese domain-containing protein  52.03 
 
 
263 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0638463 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  47.27 
 
 
623 aa  248  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01514  rhodanese superfamily protein  51.44 
 
 
253 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249305  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2090  rhodanese superfamily protein  50 
 
 
257 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2178  rhodanese superfamily protein  49.61 
 
 
266 aa  238  9e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.258841  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1437  rhodanese superfamily protein  52.46 
 
 
255 aa  225  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15403  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  43.11 
 
 
337 aa  224  1e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  41.88 
 
 
336 aa  223  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  41.7 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  42.4 
 
 
312 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  42.66 
 
 
323 aa  216  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0216  hypothetical protein  42.12 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32074  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  42.05 
 
 
312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  41.13 
 
 
310 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  40.78 
 
 
310 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1349  hypothetical protein  42.05 
 
 
310 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  42.24 
 
 
309 aa  210  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  39.93 
 
 
352 aa  209  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  43.32 
 
 
339 aa  209  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  40.14 
 
 
352 aa  208  6e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  41.76 
 
 
326 aa  209  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  41.7 
 
 
310 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  41.37 
 
 
331 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  41.16 
 
 
312 aa  206  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  41.34 
 
 
317 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  40.07 
 
 
334 aa  205  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1781  hypothetical protein  39.93 
 
 
326 aa  205  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  40.78 
 
 
334 aa  205  8e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  39.58 
 
 
341 aa  204  9e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  40.78 
 
 
334 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  40.78 
 
 
334 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0878  hypothetical protein  40.66 
 
 
332 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000330025  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  40.78 
 
 
334 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2660  rhodanese domain-containing protein  39.36 
 
 
326 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  normal  0.0411957 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  40.66 
 
 
326 aa  202  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  40.64 
 
 
317 aa  201  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  41.16 
 
 
306 aa  201  8e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  39.58 
 
 
333 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  39.43 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  39.58 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  39.58 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  39.93 
 
 
313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  39.43 
 
 
302 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 
328 aa  200  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0473  rhodanese-related sulfurtransferase  44.21 
 
 
237 aa  199  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1694  putative sulfurtransferase  43.8 
 
 
237 aa  198  7.999999999999999e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  40.07 
 
 
314 aa  198  7.999999999999999e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  38.21 
 
 
294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  38.87 
 
 
333 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4255  rhodanese domain-containing protein  40.66 
 
 
305 aa  194  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3823  hypothetical protein  40 
 
 
314 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2782  rhodanese domain-containing protein  39.93 
 
 
315 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  39.72 
 
 
555 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3401  Rhodanese domain protein  40.29 
 
 
309 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0081  rhodanese family protein  40.66 
 
 
305 aa  192  6e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3699  Rhodanese domain protein  41.39 
 
 
309 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1892  rhodanese-like protein  38.85 
 
 
269 aa  192  7e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1973  rhodanese domain-containing protein  38.63 
 
 
332 aa  192  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000137009  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0086  rhodanese family protein  40.66 
 
 
308 aa  191  8e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  41.22 
 
 
305 aa  191  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3915  rhodanese domain-containing protein  42.91 
 
 
257 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0850  rhodanese domain-containing protein  40.14 
 
 
322 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  38.99 
 
 
326 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1535  hypothetical protein  39.56 
 
 
350 aa  190  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3429  rhodanese-like protein  39.92 
 
 
299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  37.55 
 
 
327 aa  189  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1939  rhodanese domain-containing protein  38.25 
 
 
316 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1677  rhodanese domain-containing protein  39.21 
 
 
311 aa  188  8e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0239386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>