201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1272 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1272  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
108 aa  217  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1182  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
108 aa  217  5e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0128557  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0324  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.65 
 
 
102 aa  90.1  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.76 
 
 
104 aa  77  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000824  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0744  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.78 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0539  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.78 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000746068  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.78 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3414  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.36 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1932  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.63 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0522  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.89 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.508742  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0864  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.86 
 
 
137 aa  67  0.00000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0100749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.05 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.886017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5154  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.05 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000334813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4986  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.05 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.761733  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5004  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.05 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000172013  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5525  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.05 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000524846  hitchhiker  0.00000000227919 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5546  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.05 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5395  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.05 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03867e-36 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5425  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.05 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0122155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5481  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.05 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3824  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.05 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.31 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5102  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.02 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3302  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.47 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_504  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.82 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115824  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.32 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1237  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.04 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.65 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0062  ATP synthase F1, epsilon subunit  30 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0084  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.05 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.78895  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.13 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3735  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.69 
 
 
139 aa  60.1  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2136  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.32 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0468  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.04 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.3605  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2756  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.67 
 
 
148 aa  57.8  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.13 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.63 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3405  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.63 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.31 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0901  ATP synthase F1 subunit epsilon  33.33 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.20439  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4073  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.84 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000149608  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3628  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  33.33 
 
 
94 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160412  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.31 
 
 
148 aa  53.5  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4034  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.57 
 
 
138 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113371 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.57 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4790  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.8 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.18 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.18 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4331  hypothetical protein  32.29 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132194  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.18 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.18 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0666  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  29.29 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.177829  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.18 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.18 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.09 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.18 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.09 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3130  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.77 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0204  ATP synthase F1, epsilon subunit  24.79 
 
 
134 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.09 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.09 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.09 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.09 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.09 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3386  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  24.3 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1508  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.43 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0114  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.59 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.693828  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2164  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.76 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.29 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.187642  hitchhiker  0.000120688 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2138  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.93 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2176  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.93 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0466412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1672  ATP synthase epsilon subunit  27.68 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.485979 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3169  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.59 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00353797  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4010  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  35 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597874 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2319  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.16 
 
 
121 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397323  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0085  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.18 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3875  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.05 
 
 
121 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175263  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.05 
 
 
121 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00323652  decreased coverage  0.0034506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3861  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.05 
 
 
121 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00697142  normal  0.0107647 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0950  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.77 
 
 
138 aa  50.1  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.594443  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4327  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.16 
 
 
121 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.906637  normal  0.0303459 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17790  ATP synthase F1, epsilon subunit  24.24 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3307  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.09 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0874  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.32 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1024  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.62 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2189  ATP synthase F1, epsilon subunit  27 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3656  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.91 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.18 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0464757  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0027  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.28 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3710  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.91 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.737709  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0273  ATP synthase F1, epsilon subunit  28.12 
 
 
134 aa  48.9  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.16135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1423  ATP synthase F1, epsilon subunit  24.49 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1637  ATP synthase F1, epsilon subunit  27.27 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1087  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.24 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1708  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.3 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239436  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1025  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.27 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3893  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.27 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159746  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>