76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0289 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 		 104 aa  208  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000824  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0324  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.24 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1182  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.76 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0128557  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1272  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.76 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0085  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.24 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3735  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.8 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0744  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.84 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2609  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.9 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.182872  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2015  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.38 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_504  ATP synthase F1, epsilon subunit  28.92 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115824  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.26 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1423  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.77 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.92 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0084  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.89 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.78895  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0028  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  34.21 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0539  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.71 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000746068  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18170  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  34.38 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.316901 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17790  ATP synthase F1, epsilon subunit  29.55 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.71 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1025  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.65 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4164  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.58 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000197005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0204  ATP synthase F1, epsilon subunit  28.21 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0177  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.12 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.27 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1708  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.95 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239436  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21390  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  35 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0273  ATP synthase F1, epsilon subunit  26.92 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.16135  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.49 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1402  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.9 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.537501  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1024  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.77 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3414  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.21 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4986  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.91 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.761733  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5481  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.91 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5425  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.91 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0122155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5525  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.91 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000524846  hitchhiker  0.00000000227919 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5395  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.91 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03867e-36 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5004  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.91 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000172013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5546  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.91 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5154  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.91 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000334813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.91 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.886017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5102  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.91 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3824  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.91 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.51 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4010  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  29.73 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597874 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.77 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.83 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3302  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  24.39 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0115  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0001138  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0049  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  30.86 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.116999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0468  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.16 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.3605  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2138  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.95 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3628  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  28.36 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1932  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.85 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2176  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.95 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0466412  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3706  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.16 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf049  ATP synthase epsilon subunit  30.88 
 
 		 119 aa  42  0.003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3169  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.05 
 
 		 138 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00353797  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1046  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.33 
 
 		 136 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.100266 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl116  ATP synthase epsilon chain  28.21 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3457  ATP synthase F1, epsilon subunit  28.75 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0381  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.36 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3405  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.61 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4617  ATP synthase F1, epsilon subunit  26.58 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3416  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  32.91 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0666  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  23.17 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.177829  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0864  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0100749  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1087  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.91 
 
 		 136 aa  40.4  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35127  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  33.68 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0143  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.05 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000440039  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0103  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.05 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  24.39 
 
 		 138 aa  40  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0918  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.05 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0350639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4790  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.95 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4073  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.63 
 
 		 136 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000149608  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0874  ATP synthase F1, epsilon subunit  26.83 
 
 		 135 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3130  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  22.89 
 
 		 138 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>