17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl116 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl116  ATP synthase epsilon chain  100 
 
 
99 aa  197  3e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0085  ATP synthase F1, epsilon subunit  59.18 
 
 
99 aa  120  9e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.38 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.11 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.77 
 
 
142 aa  50.4  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.11 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2138  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.05 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2176  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.05 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0466412  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0874  ATP synthase F1, epsilon subunit  27.5 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17790  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.94 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1182  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.03 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0128557  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1272  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.03 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0273  ATP synthase F1, epsilon subunit  25.26 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.16135  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  24.36 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3386  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.41 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.21 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000824  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1708  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.21 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>