More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3243 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3243  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 276 aa  574  1.0000000000000001e-163  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.574352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  36.03 
 
 		 269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711153  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4669  MCP methyltransferase, CheR-type  33.58 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  33.71 
 
 		 302 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  31.95 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  34.85 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  31.58 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  30.97 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  36.33 
 
 		 275 aa  152  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0904  MCP methyltransferase, CheR-type  34.09 
 
 		 267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  33.45 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04754  CheR methyltransferase, SAM binding domain  34.09 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584849  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.7 
 
 		 276 aa  149  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0466  MCP methyltransferase, CheR-type  29.32 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176521 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  31.72 
 
 		 283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  32.71 
 
 		 301 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  32.34 
 
 		 301 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  32 
 
 		 303 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0614  MCP methyltransferase, CheR-type  30.18 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  29.62 
 
 		 275 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  35.77 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0875  MCP methyltransferase, CheR-type  35.07 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  33.7 
 
 		 297 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  32.95 
 
 		 414 aa  142  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  31.99 
 
 		 272 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  31.01 
 
 		 267 aa  142  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0267  protein-glutamate O-methyltransferase  31.32 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.647736 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1988  Protein-glutamate O-methyltransferase  32.45 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0975  MCP methyltransferase, CheR-type  32.73 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  31.95 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1146  MCP methyltransferase, CheR-type  30.94 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.492811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1587  chemotaxis methyltransferase, CheR2  30.6 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0239  protein-glutamate O-methyltransferase  30.6 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  32.71 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  30.4 
 
 		 269 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  31.54 
 
 		 288 aa  139  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2325  chemotaxis protein methyltransferase CheR  30.36 
 
 		 275 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5610  MCP methyltransferase, CheR-type  31.97 
 
 		 303 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  30.42 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1528  MCP methyltransferase, CheR-type  32.13 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.168715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3546  MCP methyltransferase, CheR-type  35.36 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  0.882443 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  33.08 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  32.45 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  31.97 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  30.65 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  32 
 
 		 289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  31.95 
 
 		 303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2815  MCP methyltransferase, CheR-type  32.44 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.904459  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  30.57 
 
 		 303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1330  protein-glutamate O-methyltransferase  30.65 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1610  MCP methyltransferase, CheR-type  30.11 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  32.33 
 
 		 276 aa  135  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  30.29 
 
 		 283 aa  135  7.000000000000001e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0878  MCP methyltransferase, CheR-type  31.68 
 
 		 275 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  30.74 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3302  MCP methyltransferase, CheR-type  30.71 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.905154 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1199  methylase of chemotaxis methyl-accepting protein, CheR-like  31.84 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  30.89 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4376  MCP methyltransferase, CheR-type  32.06 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  32 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  32.34 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1379  MCP methyltransferase, CheR-type  33.21 
 
 		 553 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  32.09 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1565  protein-glutamate O-methyltransferase  32.37 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.724121  normal  0.553309 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  30.19 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  31.97 
 
 		 277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1617  MCP methyltransferase, CheR-type  31.67 
 
 		 289 aa  132  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1152  protein-glutamate O-methyltransferase  34.23 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  27.34 
 
 		 281 aa  132  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  31.72 
 
 		 279 aa  132  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  30.28 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  31.72 
 
 		 279 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  31.72 
 
 		 279 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  31.16 
 
 		 279 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  31.16 
 
 		 279 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  31.16 
 
 		 279 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  30.22 
 
 		 286 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  31.16 
 
 		 279 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0295  chemotaxis protein methyltransferase CheR  31.82 
 
 		 277 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  32.09 
 
 		 275 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  32.09 
 
 		 275 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  29.88 
 
 		 285 aa  131  9e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0335  MCP methyltransferase, CheR-type  30.66 
 
 		 280 aa  131  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  30.22 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  30.22 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  31.72 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  30.83 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  32.09 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  31.52 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1098  protein-glutamate O-methyltransferase  31.47 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  31.9 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  30.22 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  29.52 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  30.36 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  30.22 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  31.07 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  29.88 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  30.47 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2434  putative MCP methyltransferase, CheR1  31.2 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4819  MCP methyltransferase, CheR-type  29.96 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  hitchhiker  0.00962017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>